习以为「肠」:结直肠癌组织大队列预后分析揭秘|WeOmics O40

文摘   科学   2024-11-16 09:57   贵州  

“Westlake Proteomics Series” (WeOmics) O系列研讨会第40期:


 研讨会主题:临床肿瘤组织大队列预后分析揭秘——结直肠癌专题

 直播时间:2024年11月18日(周一)2:00PM

 点击预约视频号直播


 报告专家:

徐凯伦,Kailun Xu

浙江大学医学院附属第二医院乳腺外科医师

浙江大学肿瘤学特聘副研究员


蔡雪,Xue Cai 
西湖大学 博士生



直播预热-嘉宾报告论文先了解:


8月13日,西湖大学医学院郭天南团队,联合浙江大学医学院附属第二医院邵营宽、袁长征,西京医院聂勇战团队,共同在 Cell Discovery 发表了通讯文章 Prediction of overall survival in stage II and III colon cancer through machine learning of rapidly-acquired proteomics,开发了一种基于蛋白质组数据的结肠癌患者高低危风险的分类模型。

研究通过收集230例II期和III期结肠癌患者的蛋白质组学和临床数据,使用LASSO回归筛选出9种关键蛋白质,结合临床特征建立了预测结肠癌高低风险的模型。

研究结果显示,结合蛋白质组和临床特征的模型在训练集中预测5年生存率的AUC值达到0.926,在外部验证集中为0.872,显著优于单一临床模型或蛋白质模型。该模型有效地将患者分为低风险组(训练集5年生存率95%,验证集93%)和高风险组(训练集39%,验证集53%),为结肠癌患者的个性化治疗提供了重要依据。

论文链接:
https://www.nature.com/articles/s41421-024-00707-7

文献解读:

Cell Discov|浙大、西湖学者:机器学习预测结肠癌患者高低危风险



西湖欧米是一家专注于AI赋能的微观世界数据公司,致力于多组学精准医学的转化落地,目前专注于基于蛋白质谱技术的疾病生物标记物IVD试剂盒的开发。

欧米的科研服务包括高深度血液蛋白质组学空间蛋白质组学微量组织蛋白质组学宏蛋白质组学等特色业务。截至目前,已和合作者在 CellImmunityCell DiscoveryMolecular CellCell ReportsNature CommnuicationsCell Reports MedicineNature Protocols 等多种杂志上发表多篇高质量蛋白质组学相关的研究论文。


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