大家好呀!又到了甄博每天和大家一起学习的时间啦!
近两年生信类文章大火,咱们做中医药研究的宝子们也要紧跟潮流呀!将传统的中草药与网络药理学结合起来,可以缩短发文周期,快速上岸!
网络药理学可以构建和整合“疾病-基因-通路-药物”网络,对于中药复方来说,是非常有效的研究手段。
今天,甄博给大家分享一篇最近发表在International Immunopharmacology上的文章,作者通过网络药理学预测Erianin作用靶点,并通过分子对接和体内外实验验证其通过PI3K/AKT和NF-κB途径减轻脑缺血再灌注损伤的效果。文章40天接收,一起来看看精彩之处吧~
1. 本研究创新性地结合网络药理学分析与分子对接技术,预测并验证了Erianin通过靶向PI3K/AKT和NF-κB信号通路发挥作用的分子机制。
2. 揭示了Erianin在体内外实验中对小胶质细胞极化的双向调控作用,为脑缺血再灌注损伤提供了新的治疗策略和分子靶点。
(PS:网络药理学的思路和分析目前比较成熟了,趁着国家大力扶持的东风,快来换一种疾病或者药物复现吧~)
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l题目:Erianin通过PI3K/AKT和NF-κB通路抑制小胶质细胞极化和炎症,缓解脑缺血再灌注损伤l杂志:International ImmunopharmacologyErianin是从中草药石斛中提取的天然化合物,具有抗炎和神经保护特性。本研究探讨了Erianin在脑缺血再灌注损伤(CI/RI)中的治疗潜力及其通过PI3K/AKT和NF-κB途径抑制小胶质细胞极化和炎症的机制,为开发针对CI/RI和其他神经系统疾病的新治疗策略提供了科学依据。本研究首先通过网络药理学分析预测Erianin的潜在靶点和与CI/RI相关的信号通路。接着,通过体内外实验评估Erianin对CI/RI的神经保护效果,探讨其对小胶质细胞极化、神经炎症及PI3K/AKT和NF-κB信号通路的影响,阐明其治疗CI/RI的分子机制。1、网络药理分析预测Erianin与CI/RI之间的靶点本研究通过网络药理学方法鉴定了Erianin的391个潜在靶蛋白,并与CI/RI相关靶点相交得到101个共同靶点。PPI网络分析揭示了10个核心靶点,GO和KEGG分析富集了生物学过程和信号通路,其中PI3K/AKT1信号通路与Erianin治疗作用密切相关,表明Erianin可能通过该通路发挥神经保护效果(图1)。 图1中药成分苦参苷与CI/RI相关靶蛋白相互作用网络的构建2、苦参素通过靶向PI3K-AKT通路减轻大鼠CI/RI模型的缺血改变建立大鼠脑缺血再灌注损伤(CI/RI)模型,评估了不同剂量Erianin的治疗效果。结果显示,Erianin能显著改善神经功能缺陷,减少脑缺血面积和神经元损伤,并呈剂量依赖性抑制细胞凋亡。Western blot分析表明Erianin通过激活PI3K/AKT信号通路发挥作用,证实了其对CI/RI的潜在治疗价值(图2)。 图2 建立大鼠脑缺血再灌注模型,探讨苦楝素的体内治疗作用3、Erianin抑制OGD/R刺激的炎症反应和小胶质细胞的极化 Erianin能在体外实验中通过不同浓度减轻OGD/R诱导的小胶质细胞损伤,提高细胞活力。qRT-PCR和ELISA分析显示Erianin能够降低促炎因子IL-1β的表达和分泌,同时增加抗炎因子IL-4和IL-10的水平。此外,Erianin通过减少CD86和IBA-1的表达,提高CD206表达,抑制了小胶质细胞的神经炎症。通过PI3K抑制剂LY294002的实验表明,Erianin可能通过PI3K途径抑制小胶质细胞凋亡,证实了Erianin对神经炎症和细胞极化的调节作用(图3)。图3 Erianin对体外OGD/R刺激的小胶质细胞的炎症反应和极化有抑制作用4、Erianin通过抑制NF-κB通路减轻缺血再灌注过程中小胶质细胞的极化先前研究指出Erianin能通过抑制ERK1/2-NF-κB信号通路减轻视网膜炎症。本研究进一步发现,在缺血再灌注损伤中,Erianin通过减少NF-κB p65的表达和核内转移,抑制了小胶质细胞的炎症和极化,揭示了其神经保护作用的分子机制(图4)。 图4 Erianin通过抑制NF-κB通路抑制小胶质细胞的炎症和极化 这篇文章展示了生物信息学和网络药理学在现代中药研究中的应用,低成本高效率地揭示了Erianin在脑缺血再灌注损伤中的治疗机制,中医药研究的小伙伴可以借鉴一下这个思路!所以中医药方向的小伙伴要赶紧抓住机会,利用生信助攻中医药实验研究,缩短研究周期,尽早发文,同时这个思路还可以拓展成为国自然课题,一举两得!想复现思路的朋友快快联系甄博吧!文献信息:PMID: 39146784 DOI: 10.1016/j.intimp.2024.112915科研从来不只是科研,科研还是一项重要的投资。甄博团队始终跟着科研热点导向,指导你课题设计、标书评估、个性化分析思路定制。关注甄博,领取免费原创课程(干货满满),拥抱高性价比的科研人生~云服务器租赁
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