师弟逆袭记:如何通过租服务器,从实验室新手到生信专家的华丽转身

文摘   2024-10-28 16:30   山东  

大家好!今天我想和大家分享一个关于我的“靠谱”的师弟的故事。这一切始于老板让我带领一个新来的师弟学习如何进行实验。我心想,这有什么难的?不就是带个新人吗。

然而,我这个师弟的时间观念简直像是处于“量子态”。每天一到下午5点半,他就像被某种神秘力量召唤一样,准时离开实验室。有一次,我让他帮我洗个瓶子,他却回答说:“师兄,我今天手气不好,怕洗的瓶子影响你的实验结果。”我心里想:如果不想洗就直接说,别把原因归咎于我的实验结果。

我向老板抱怨:“老板,这个师弟我真的带不动。”老板却说:“你再试试,也许他只是需要一些时间适应。”我无奈地回答:“老板,我有的是时间,但我怕他会把我也‘试试’到没时间。”

老板后来告诉我,师弟写了一篇文章需要我帮忙修改。我心想,我没怎么见他在实验室里忙碌,怎么写出文章来了?一问之下,才知道师弟自己花了几千块钱租了一台服务器,晚上自学写代码,挖掘了我们领域的公共数据,并据此完成了这篇文章。

这位师弟后来怎么样了呢?他成功地转行到了生物信息学领域,并且顺利毕业了。而我呢?后来我也转向了生物信息学。

这个故事主要是想告诉大家,如果你对传统实验不感兴趣,不妨考虑转行到生物信息学。因为生物信息学真的太吸引人了。

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配置

线程

 内存

存储 

1个月

1年

2年

独享

72

256G

16T

2350

14000

23800

72

512G

16T

2900

18000

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128

1024G

16T

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GPU其他配置:cpu E5-2683 v3;单台机器最大支持2张


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服务器参数

72线程256G内存为例

linux系统Ubuntu 20.04

CPU参数:2686V4 *2 36核72线程 主频2.3GHZ

内存:DDR4 256G内存

硬盘:共享单个用户1T存储,支持扩容,扩容收费200/T/年


常见问题

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问:服务器常用软件都有什么?

答:常规的生物数据分析的软件都有:R 以及Rstudio、python、perl、samtools、BLAST、hisat2、bwa以及conda等,这些软件正在不断完善中。

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