Nat Commun | 猴面包树染色体级基因组揭示了其演化轨迹和环境适应性

学术   2024-10-13 03:18   法国  

Kitony JK, et al. (2024). Chromosome-level baobab genome illuminates its evolutionary trajectory and environmental adaptation. Nature Communications, 15: 8833.


(2024年10月12日发表)


摘要参考翻译:猴面包树(Adansonia digitata)是非洲特有的长寿树种,具有重要的经济、生态和文化价值,但其基因组特征却未得到充分探索。本研究报告了以42条染色体为基础的猴面包树染色体级参考基因组,以及一株姊妹株(sibling)、来自非洲不同地区的两株树和来自马达加斯加的A. za的基因组初步组装(译者注:这里的样品名称及来源是根据字面意思和句子结构理解翻译的,可能有误;具体信息请查看原文)。猴面包树基因中DNA转座子非常丰富,占33%;而LTR逆转录转座子占10%。猴面包树在大约3千万年前经历了全基因组加倍(whole genome multiplication),随后在3百万年至1千1百万年前发生了第二次全基因组加倍事件,这可能与同源四倍体(autotetraploidy)有关。对 25株树的重测序发现了3个亚群,西非的基因流与东非的基因流截然不同。基因富集和固定指数(Fst)分析表明猴面包树保留了多个与昼夜节律、开花和光响应相关的基因,这些基因很可能通过紫外线抗性位点8(UVR8)途径支持猴面包树的长寿。总之,我们为猴面包树的育种和保护提供了基因组资源和见解。


猴面包树基因组的特征


点击下方“阅读原文”可查看英文全文。


声明:本内容未向其他微信公众号投稿。

EcoloJi
生态学泛读。分享(我以为)有趣的科研动态和方法。
 最新文章