Song Y, et al. (2024). Seed tuber microbiome can predict growth potential of potato varieties. Nature Microbiology, doi: https://doi.org/10.1038/s41564-024-01872-x.
（2024年12月27日发表）
摘要参考翻译：马铃薯活力，即种薯的生长潜力，是一个重要的农艺性状，其在不同生产区域间因遗传背景和环境条件等因素而显著变化。种薯微生物组被认为会影响植株健康和作物产量，但微生物组组成与马铃薯活力之间的具体关系仍不清楚。本研究对6个马铃薯品种在240块田中种植的种薯芽眼和脐部进行了微生物组测序。在下一个种植季，通过对三个试验田进行时间分辨的无人机影像追踪作物生长发育，我们将微生物组组成与马铃薯活力建立了关联。我们利用不同分类水平的微生物组数据构建了随机森林预测模型，发现基于扩增子序列变异（amplicon sequence variants）的模型预测马铃薯活力的准确性最高。模型揭示了种薯微生物组与下一季作物活力之间的品种特异性关系。在对表现最好的品种中，模型的决定系数（R²）达到0.69，能够准确预测未参与分析田中的种薯活力。此外，模型识别出了对活力预测最重要的关键微生物指标，其中一个链霉菌（Streptomyces）、一个不动杆菌（Acinetobacter）和一个纤维杆菌（Cellvibrio）的扩增子序列变异是贡献模型准确性的重要因素。本研究表明，基于种薯芽眼相关的微生物组可以可靠预测马铃薯活力，这为未来基于微生物组的育种策略提供了潜在的指导。
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