Nature | 早期中世纪欧洲的高分辨率基因组历史

学术   2025-01-02 08:43   云南  

编者按:第一作者Leo Speidel将是3月份在中国科学院西双版纳热带植物园种群基因组学培训班(培训班信息:2025 XTBG Population Genomics Workshop)的授课教师之一,机会难得,不容错过。


Speidel L, et al. (2024). High-resolution genomic history of early medieval Europe. Nature, 637: 118–126.


(2025年1月1日发表)


摘要参考翻译:许多已知和未知的历史事件由于微弱的祖先变迁难以重建,一直未能被遗传学研究检测到。基于共享单倍型和稀有变异的方法虽能提高研究能力,但这些方法不具备明确的时间属性,且无法在无偏的祖先模型中应用。在此,我们开发了Twigstats,一种时间分层的祖先分析方法,通过聚焦于近期的共同祖先事件,显著提高了统计能力,提升幅度可达一个数量级,同时避免了受特定种群漂变的影响。我们将该框架应用于1,556个欧洲历史时期的古代全基因组数据,成功利用先前的基因组数据以高分辨率建模个体层级的祖先来源。在公元1千年的上半叶,我们观察到至少有两股与斯堪的纳维亚相关的祖先流扩展至西欧、中欧和东欧。而在1千年的下半叶,这些祖先流在地区性上消失或发生了显著的混合。在斯堪的纳维亚地区,我们发现到约公元800年期间,出现了主要的祖先涌入,当时大量维京时代个体携带着来自中欧相关群体的祖先成分,这在早期铁器时代个体中尚未观察到。我们的研究表明,时间分层的祖先分析能够为遗传历史提供更高分辨率的视角。


Twigstats在模拟数据上的表现


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