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贝纳基因自研的DNA提取试剂盒+完善的提取和建库测序的工艺流程,保证测序读长足够长;庞大的GPU集群+Dorado V5的最新Basecall大模型,保证得到正确的序列,实现又长又准的测序。
ONT重测序数据由于读长较长,同时可检测甲基化信息,对SV的准确鉴定及甲基化关联研究是非常有帮助的。但是,一直以来由于ONT序列准确性不足(R9芯片,准确性Q11),尤其在检测重复序列区域插入缺失变异(InDels)时更容易出现错误,导致ONT在重测序领域无法发挥其真正的价值!
SAR20 ONT重测序数据准确性可达到Q20以上,同时插入缺失变异(InDels)错误显著降低;甲基化修饰可同时检测6mA/5mC/5hmC/4mC等,检测准确性均在97%以上。基于ONT重测序可以对结构变异SV及甲基化修饰分析一网打尽!
实测数据:
不同basecalling模式下Q值的比较
注:原有高精度Hac basecalling质控模型,hac-v4.3.0,单链读取Q11(准确性:92.06%);hac-v5.0.0,单链读取Q11(准确性:92.06%);超高精度Sup basecalling质控模型,sup-v4.3.0,单链读取Q16(准确性:97.49%);SAR,达到单链读取Q20(准确性:99.00%)
上层为SAR数据,下层为原ONT R9数据,错误插入缺失变异(InDels)明显减少。
SAR与ONT R9重测序数据比较
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