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贝纳基因自研的ONT super-long提取试剂盒+完善的提取和建库测序的工艺流程,保证测序读长足够长,目前可实现N50>200K;庞大的GPU集群+Dorado V5的最新Basecall大模型,保证得到正确的序列,实现又长又准的测序。
ONT超长测序在T2T基因组组装过程中起着关键的作用,但是ONT数据准确性不足,需要使用二代数据或HIFI数据进行纠错;目前SAR20 ONT超长测序的实现,将有效提高ONT组装基因组的准确性。
01
实测一:
人类样本,SAR Q20数据碱基质量中位值达到Q28(准确性:99.84%);
不同basecalling模式下Q值的比较
注:原有高精度Hac basecalling质控模型,hac-v4.3.0,单链读取Q20(准确性:99%);hac-v5.0.0,单链读取Q21(准确性:99.2%);超高精度Sup basecalling质控模型,sup-v4.3.0,单链读取Q24(准确性:99.60%);SAR,达到单链读取Q28(准确性:99.84%)。
02
实测二:
植物样本SAR Q20数据碱基质量中位值达到Q20 (准确性:99.00%)
不同basecalling模式下Q值的比较
注:原有高精度Hac basecalling质控模型,hac-v4.3.0,单链读取Q11(准确性:92.06%);hac-v5.0.0,单链读取Q11(准确性:92.06%);超高精度Sup basecalling质控模型,sup-v4.3.0,单链读取Q16(准确性:97.49%);SAR,达到单链读取Q20(准确性:99.00%)。
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