贝纳基因ONT超精度测序SAR Q20系列产品——SAR20 全长定量转录组

学术   2024-09-13 17:20   湖北  

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贝纳基因自研的RNA提取试剂盒+完善的提取和建库测序的工艺流程,保证测序读长足够长;庞大的GPU集群+Dorado V5的最新Basecall大模型,保证得到正确的序列,实现又长又准的测序。


全长定量转录组的单链读取准确率从Q11(92%)提升到Q23(99.50%)以上。


不同basecalling模式下Q值的比较(贝纳实测数据)


注:原有高精度Hac basecalling质控模型,hac-v4.3,单链读取Q16(准确性:97.48%);hac-v5,单链读取Q19(准确性:98.74%);超高精度Sup basecalling质控模型,sup-v4.3,单链读取Q22(准确性:99.37%);SAR20 sup-v5,达到单链读取Q25(准确性:99.68%)。


部分SAR20 全长定量转录组实测数据展示


贝纳基因使用全长定量转录组测序技术可以准确分析可变剪接、融合基因和鉴定新异构体,实现转录本表达水平的准确定量。贝纳基因现已完成10000+样本的全长定量转录组测序服务,覆盖人细胞和肿瘤,动植物组织和细胞、真菌、病毒等各类型的样品,并发表多篇高水平文章。









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武汉贝纳科技有限公司(下称"贝纳基因")成立于2012年,总部位于武汉高农生物园,是一家专注于Nanopore测序、二代测序和生物信息分析技术开发和应用的国家高新技术企业。核心团队拥有多年高通量测序、Nanopore测序和生物信息分析经验,在Nature和Science系列杂志发表多篇学术论文,博士、硕士学历员工占企业员工总数的72%。拥有自主测序平台(国内首批引进Nanopore PromethION平台)和专业的生物信息分析团队。


贝纳基因使用Nanopore平台完成全球第一个大型复杂植物基因组(菊花基因组)的组装和后续分析工作。提出并推动千种本草基因组计划,并构建药用植物基因组数据库,推动药材研究的发展。


贝纳基因使用Nanopore平台完成数千份细菌基因组、宏基因组测序和数据分析;完成数千份全长转录组和Direct转录组测序及分析。提出并推动基于Nanopore测序的万种微生物基因组完成图计划和十万人的Nanopore宏基因组研究计划。


贝纳基因开发了基于Nanopore平台的微生物检测体系,自主开发的数据库涵盖现已正式发表的所有微生物基因组,大型测序仪单机一次运行可以产生7.2T数据,小型便携式测序系统可用于临床检测和野外作业。


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