超三分之一二区以上,两篇药靶孟德尔随机化发同一期刊(IF=5)| 孟德尔随机化周报(8.15-8.21)

文摘   健康   2024-08-29 17:44   浙江  

本周孟德尔随机化共发表21篇二区以上文章,二区发表率为35%。而在昨天刚发表的NHANES数据库汇总中,我们提出了一个问题:24篇二区以上,Nhanes二区发文率是否会超越孟德尔随机化?
今天这篇文章给你答案!NHANES数据库二区发文率58.5%,短暂超过孟德尔随机化!但从发文量来说,还得看孟德尔随机化。
孟德尔随机化,Mendelian Randomization,简写为MR,是一种在流行病学领域应用广泛的一种实验设计方法,利用公开数据库就能轻装上阵写文章,甚至是高质量的论文。


通过PubMed数据库“ Mendelian randomization”检索发现,8.15-8.21共发表60相关主题论文,其中共8医学1区,13篇医学2区文章,部分文章介绍如下。


中国学者:


1.国学者文章介绍(一)

文章题目:基于基因的蛋白质组全扫描揭示了特发性肺纤维化的潜在致病血浆蛋白
研究目的:特发性肺纤维化 (IPF) 是一种致命的肺部疾病,没有可靠的生物标志物或疾病调节药物。在这里,我们整合了人类基因组学和蛋白质组学,以研究 2769 种浆蛋白与 IPF 之间的因果关系。
研究方法:我们的孟德尔随机化分析确定了九种与 IPF 相关的蛋白质,其中三种(FUT3、ADAM15 和 USP28)共定位。
研究结果:ADAM15成为最大的候选基因,这得到了血液和肺组织中表达数量性状位点分析的支持。

结论:这些发现为IPF的病因提供了新的见解,并为应对这种毁灭性疾病的临床挑战提供了转化机会。


2.国学者文章介绍(二)

文章题目血浆脂质组、炎症蛋白质组和心力衰竭的孟德尔随机化
研究目的:心力衰竭 (HF) 是一个全球性健康问题,脂质代谢和炎症与其进展密切相关。这项研究利用尖端的、扩展的遗传信息来分析脂质和炎症蛋白谱,采用孟德尔随机化 (MR) 来揭示 HF 的遗传风险因素。
研究方法:我们使用来自最近全基因组关联研究 (GWAS) 和蛋白质组全数量性状位点 (pQTL) 研究的工具变量 (IV) 评估了 179 种脂质组和 91 种炎症蛋白对 HF 的遗传易感性。涉及 47 309 例 HF 病例和 930 014 例对照的 GWASs 来自心力衰竭分子流行病学治疗靶点 (HERMES) 联盟。HGRI-EBI目录中提供了来自芬兰队列中7174名个体的179种脂质和来自欧洲pQTL研究的91种炎症蛋白的数据,该研究涉及14 824名个体。双样本 MR 方法评估了相关性,两步中介分析探索了炎症蛋白在脂质-HF 通路中的中介作用。敏感性分析,包括 MR-RAPS(稳健调整轮廓评分)和 MR-Egger,确保了结果的稳健性。
研究结果: 成功鉴定了 162 种脂质和 74 种炎症蛋白的基因 IV。MR 分析显示 HF 与 31 种脂质之间存在遗传关联。其中甾醇酯(27:1/18:0)、胆固醇、9种磷脂酰胆碱、磷脂酰肌醇(16:0_20:4)和6种三酰基甘油等18种脂质被鉴定为HF危险因素[比值比(OR)=1.037-1.368]。胆固醇与心衰风险升高的相关性最显著[OR=1.368,95%置信区间(CI)=1.044-1.794,P=0.023]。在炎症蛋白质组中,白血病抑制因子受体(OR=0.841,95%CI=0.789-0.897,P=1.08E-07),成纤维细胞生长因子19(OR=0.905,95%CI=0.830-0.988,P=0.025)和尿激酶型纤溶酶原激活因子(OR=0.938,95%CI=0.886-0.994,P=0.030)与HF呈因果负相关,而白细胞介素-20受体亚基α(OR=1.333,95%CI=1.094-1.625,P=0.004)与HF呈因果正相关。中介分析显示白血病抑制因子受体(介导比例:23.5%-25.2%)和尿激酶型纤溶酶原激活剂(介导比例:9.5%-10.7%)作为脂质-炎症-HF通路的中介。未观察到定向水平多效性的证据(P > 0.05)。
结论:这项研究确定了某些脂质(尤其是胆固醇)与 HF 之间的遗传联系,突出了影响 HF 风险并介导这种关系的炎症蛋白,提出了新的治疗靶点和对 HF 遗传驱动因素的见解。


3.国学者文章介绍(三)

文章题目:血清白细胞介素在癌症中的作用:一项多中心孟德尔随机化研究
研究目的:癌症的发生往往伴随着免疫逃避和促肿瘤炎症,其中白细胞介素(IL)在免疫炎症机制中起着关键作用。然而,血清白细胞介素在癌症中的确切贡献仍然难以捉摸。
研究方法: 我们从欧洲血统人群的八项独立大规模血清蛋白质组研究中获得了 35 种白细胞介素的 GWAS 汇总数据,并从 FinnGen 联盟获得了 23 种常见癌症的 GWAS 汇总数据。然后,我们进行了一项多中心孟德尔随机化 (MR) 研究,以探讨全身炎症状态与癌症之间的关系。
研究结果 :白细胞介素与癌症之间的 24 种因果关系得到了多中心数据的支持,其中 18 种是首次报告。结果表明,IL-1α(霍奇金淋巴瘤)、IL-5(膀胱癌)、IL-7(前列腺癌)、IL-11(骨恶性肿瘤)、IL-16(肺癌)、IL-17A(胰腺癌)、IL-20(膀胱癌)、IL-22(淋巴细胞白血病)、IL-34(乳腺癌)、IL-36β(前列腺癌)和IL-36γ(肝癌)是相关癌症的危险因素。相反,IL-9(子宫体恶性肿瘤)、IL-17C(肝癌)和IL-31(结直肠癌、膀胱癌、胰腺癌和皮肤黑色素瘤)对相关癌症具有保护作用。值得注意的是,还观察到血清白细胞介素的双重作用。IL-18是前列腺癌的危险因素,而IL-18是预防喉癌的保护因素。同样,IL-19促进了肺癌和髓系白血病的发展,同时对乳腺癌、宫颈癌和甲状腺癌具有保护作用。
结论:研究证实了多种血清白细胞介素与癌症之间的遗传关联。针对这些关联的免疫和抗炎策略为预防和治疗提供了机会。


4.国学者文章介绍(四)

文章题目:重度抑郁症与甲状腺疾病的因果关系:孟德尔随机化研究与中介分析
研究目的: 关于抑郁症与甲状腺疾病及其功能的关系的研究已经开展,其因果关系尚不清楚。
研究方法: 利用欧洲和东亚血统的全基因组关联研究的汇总统计,我们进行了 2 样本双向孟德尔随机化,以估计 MDD 与甲状腺功能之间的关联(欧洲:正常范围 TSH、T4、T3、fT4、TPOAb 水平和 TPOAb 阳性;东亚:T4)和甲状腺疾病(甲状腺功能减退症、甲状腺功能亢进症和桥本氏甲状腺炎),并使用中介分析来评估关联的潜在中介因子(酒精摄入、抗抑郁药)并计算介导比例。
研究结果观察到 MDD 与甲状腺功能减退症之间存在显着的因果关系 (P = 8.94 × 10-5)、甲状腺功能亢进症(P = 8.68 × 10-3)和桥本氏甲状腺炎(P = 3.97 × 10-5)在欧洲血统中,其介导因素为酒精摄入量(酒精摄入量与10年前相比甲状腺功能减退症(P = 0.026)、桥本氏甲状腺炎(P = 0.042)和甲状腺功能减退症的酒精摄入频率(P = 0.015))和抗抑郁药(甲状腺功能减退症(P = 0.008)、桥本氏甲状腺炎(P = 0.010)),但在东亚血统中则不介导(PMDD-甲状腺功能减退症= 0.016,但β方向不同;PMDD-甲状腺功能亢进症= 0.438;PMDD-桥本'S 甲状腺炎= 0.496)。无证据表明上述甲状腺功能与两代人MDD之间存在双向因果关系(P均>0.05)。
结论:重要的是,我们观察到 MDD 与欧洲血统中甲状腺功能减退症、甲状腺功能亢进症和桥本氏甲状腺炎风险之间存在显着的因果关系,而酒精摄入和抗抑郁药作为预防甲状腺功能减退症、可归因于 MDD 的桥本氏甲状腺炎的介质之间存在显着的因果关系。

5.国学者文章介绍(五)

文章题目:系统化、可成药的全基因组孟德尔随机化确定了缺血性中风后功能结果的治疗靶点
研究目的: 中风是全球死亡的主要原因,缺乏有效的治疗方法来改善预后。本研究的目的是确定缺血性中风后功能结果的新治疗靶点。
研究方法:采用可成药基因的顺式表达数量性状位点数据作为工具变量。主要结局是缺血性卒中后3个月的改良Rankin量表评分,作为二分类变量(3-6 vs 0-2)和顺序变量进行评估。进行药物靶点孟德尔随机化、Steiger滤波分析和共定位分析。此外,还进行了表型组范围的孟德尔随机化分析,以在基因水平上鉴定药物靶基因的安全性
研究结果: 在>2600个可成药基因中,16个基因(ABCC2、ATRAID、BLK、CD93、CHST13、NR1H3、NRBP1、PI3、RIPK4、SEMG1、SLC22A4、SLC22A5、SLCO3A1、TEK、TLR4和WNT10B)与顺序修饰Rankin量表存在因果关系(P<1.892×10-5)或功能结局不佳(改良Rankin量表3-6 vs 0-2,P<1.893×10-5).Steiger滤波分析表明其潜在的方向稳定性(P<0.05)。共定位分析进一步支持了遗传预测的 ABCC2、NRBP1、PI3 和 SEMG1 表达与缺血性脑卒中后功能结局之间的关联。此外,表型组范围的孟德尔随机化揭示了靶向 ABCC2、NRBP1、PI3 和 SEMG1 的疗法的额外有益适应症和很少的潜在安全性问题,但这些结果的稳健性受到低功效的限制。
结论:本研究揭示了改善缺血性脑卒中后功能结局的 4 个候选治疗靶点,但其潜在机制需要进一步研究


6.国学者文章介绍(六)

文章题目:基因预测的代谢物介导免疫细胞与代谢功能障碍相关的脂肪变性肝病之间的关联:孟德尔随机化研究
研究目的: 现有的研究对免疫细胞、血浆代谢物和代谢功能障碍相关脂肪变性肝病 (MASLD) 之间的联系提出了有限且不同的发现。本研究的目的是探讨免疫细胞与MASLD之间的因果关系。此外,我们旨在确定和量化代谢物的潜在介导作用。
研究方法: 孟德尔随机化 (MR) 分析使用来自 MASLD 全基因组关联研究的两个汇总数据样本进行,其中包括 2568 名患者和 409,613 名对照个体。此外,还采用了介导的 MR 研究来量化代谢物介导的免疫细胞对 MASLD 的影响。
研究结果:  在这项研究中,8 种免疫表型与 MASLD 的风险相关,35 种代谢物/代谢物比率与 MASLD 的发生有关。此外,共有六种免疫表型和代谢因子组合显示出对MASLD发生的影响,尽管代谢物的介导作用并不显著。
结论:我们的研究表明,某些免疫表型和代谢物/代谢物比率与MASLD具有独立的因果关系。此外,我们确定了与MASLD风险增加相关的特定代谢物/代谢物比率。然而,它们在免疫表型与MASLD之间的因果关系中的中介作用并不显着。在临床实践中,考虑 MASLD 患者的免疫和代谢紊乱非常重要。


7.国学者文章介绍(七)

文章题目:单核细胞化学引诱蛋白-1、炎症生物标志物和缺血性中风或短暂性脑缺血发作患者的预后:来自一项全国性注册研究的结果
研究目的: 最近的孟德尔随机化和荟萃分析强调了 MCP-1(单核细胞趋化蛋白-1)在卒中中的相关性。我们旨在研究缺血性中风或短暂性脑缺血发作患者的MCP-1与临床结局之间的关联,并检验炎症是否介导或共同促成这些关系。
研究方法:共纳入第三届中国国家卒中登记研究的10 700例患者。多变量 Cox 回归用于复发性卒中和全因死亡,logistic 回归用于不良功能结局。进行中介分析以阐明炎症是否介导这些关联。
研究结果: 在调整潜在混杂因素后,低 MCP-1 水平 (<337.6 pg/mL) 与全因死亡风险降低相关(风险比 [HR],0.65 [95% CI,0.51-0.82])和功能结局不佳(比值比,0.81 [95% CI,0.70-0.94]),但与复发性卒中无关 (HR, 1.10 [95% CI, 0.95-1.27]),而 MCP-1 水平高 (≥337.6 pg/mL)。MCP-1 与全因死亡之间的关联部分由高敏感的 C 反应蛋白、白细胞介素-6 和 YKL-40(几丁质酶 3 样蛋白 1;介导比例分别为 7.4%、10.5% 和 7.4%)介导。功能不良结局的相应介导比例分别为9.9%、17.1%和7.1%。MCP-1 和炎症生物标志物水平高的患者发生全因死亡和功能结局不佳的风险最高。
研究结论:血浆 MCP-1 水平低与缺血性卒中或短暂性脑缺血发作后全因死亡率和功能结局不佳的风险降低有关。炎症部分介导并共同促成了这些关联。

8.国学者文章介绍(八)

文章题目:脂质、载脂蛋白、降脂药物和脑小血管疾病的风险:孟德尔随机化研究
研究目的: 血脂与动脉粥样硬化的发生有因果关系,但它们在脑小血管疾病中的作用尚不清楚。本研究旨在探讨脂质或载脂蛋白性状在脑小血管疾病中的因果作用,并确定降脂干预措施对该疾病的影响。
研究方法: 脂质/载脂蛋白的遗传仪器数据,以及特征性脑小血管疾病表现,包括小血管卒中 (SVS) 和白质高信号 (WMH),均来自公开的全基因组关联研究。
研究结果:通过两样本孟德尔随机化分析发现,高密度脂蛋白胆固醇(OR,0.85,P=0.007)和载脂蛋白A-I水平降低(OR,0.83,P=0.005),甘油三酯水平升高(OR,1.16,P=0.025)与SVS风险较高相关。高密度脂蛋白胆固醇水平低(OR,0.93,P=0.032)与WMH体积较大相关。具体而言,与WMH相比,遗传确定的各种大小定义的脂蛋白颗粒中脂质组分的表达与SVS风险的相关性更密切。此外,采用基于孟德尔随机化的中介分析方法发现,高血压性状在中介高脂血症对SVS和WMH的因果作用方面排名靠前。对于药物靶向孟德尔随机化,HMGCR和NL1CL1基因的低密度脂蛋白胆固醇降低遗传变异等位基因和CETP基因的高密度脂蛋白胆固醇升高遗传变异等位基因预测可降低SVS的风险。
结论:目前的孟德尔随机化研究表明,遗传确定的高脂血症与脑小血管疾病(尤其是 SVS)的风险较高密切相关。降脂药物可能会被考虑用于 SVS 的治疗和预防,而不是 WMH。


外国学者

1.国学者文章介绍(一)

文章题目:胰腺内脂肪沉积对急性和慢性胰腺炎的因果效应:孟德尔随机化研究
研究内容:最近的关联研究已将胰腺内脂肪沉积 (IPFD) 与胰腺炎风险联系起来,但因果关系尚不清楚。
研究方法: 利用孟德尔随机化,我们评估了遗传预测的 IPFD 与胰腺炎之间的因果关系。该方法利用了 IPFD (n=25,617)、急性胰腺炎(n=6,787 例/361,641 对照)和慢性胰腺炎(n=3,875 例/361,641 对照)全基因组关联研究的遗传变异。
研究结果:遗传学预测的IPFD与急性胰腺炎(OR:每增加1-SD:1.40[95%CI:1.12-1.76],p=0.0032)和慢性胰腺炎(OR:1.64[95%CI:1.13-2.39],p=0.0097)显著相关。
研究结论:我们的研究结果支持IPFD在胰腺炎中的因果作用,表明减少IPFD可以降低患胰腺炎的风险。

2.国学者文章介绍(二)


文章题目:孟德尔随机化和贝叶斯共定位分析表明糖蛋白 VI 是南亚人群心源性栓塞性卒中的潜在药物靶点
研究内容:循环血浆蛋白是临床上有用的卒中风险生物标志物。我们研究了血浆蛋白与南亚血统个体中风风险之间的因果关系。
研究方法:我们应用蛋白质组范围的孟德尔随机化和共定位方法来了解 2922 种血浆蛋白对南亚血统个体中风风险的因果关系。我们从英国生物样本库(N=920)获得了血浆蛋白的遗传仪器(代理)。全基因组关联研究 中风的总结数据 (N≤11, 312) 来自 GIGASTROKE 联盟。我们的主要方法涉及Wald比率或反方差加权方法,其统计显著性设置为错误发现率为<0.1。此外,贝叶斯共定位方法评估了蛋白质组、转录组和中风表型之间的共享因果变异,以最大限度地减少连锁不平衡的偏倚。
研究结果:我们发现血浆GP6(糖蛋白VI)水平对心源性栓塞性卒中具有潜在因果效应的证据(比值比[OR]瓦尔德比率=2.53 [95% CI, 1.59-4.03];P=9.2×10-5,误发现率=0.059)。考虑相关单核苷酸多态性(SNPs)的广义孟德尔随机化,P值阈值为P<5×10-8并在 r 处聚集2=0.3,显示 GP6 对心源性栓塞性卒中的影响方向一致(OR广义逆方差加权=2.21 [95% CI, 1.46-3.33];P=1.6×10-4).共定位分析表明,血浆GP6水平与心源性栓塞性脑卒中共定位(后验概率=91.4%)。结合转录组、蛋白质组和心源性栓塞性卒中的多性状共定位显示,中等到强证据表明,这两个性状与冠状动脉和脑组织中的 GP6 表达共定位(多性状后验概率>50%)。GP6对心源性栓塞性卒中的潜在因果效应在欧洲人群中不显著(OR反方差加权=1.08 [95% CI, 0.93-1.26];P=0.29)。
研究结论:我们的孟德尔随机化和共定位联合分析表明,基因预测的 GP6 可能与南亚血统个体的心源性栓塞性卒中风险有因果关系。随着南亚血统个体的遗传数据的增加,未来应实施更大样本量的血浆GP6水平孟德尔随机化研究,以进一步验证我们的发现。此外,还需要进行临床研究,以验证GP6作为南亚人心源性栓塞性中风的治疗靶点。


3.国学者文章介绍(三)


文章题目:代谢综合征和银屑病关节炎:减肥作为疾病改善疗法的作用
研究内容:银屑病关节炎 (PsA) 是一种炎症性关节和内分泌疾病,与严重的个人和公共卫生负担有关。牛皮癣的患病率高达 1%,影响 ~20% 的牛皮癣患者。PsA 经常伴有代谢综合征 (MetS),这两种疾病的特征都是慢性促炎状态,PsA 中的几种关键细胞因子(白细胞介素 (IL)-17 和 IL-23)在 MetS 患者中也升高。
研究方法:本叙述性综述旨在提供PsA中MetS的最新信息,重点关注其患病率、发病机制、预后、治疗相互作用和未来的治疗选择。
研究结果: 与其他炎症性关节炎相比,MetS 在 PsA 中尤为普遍。队列研究表明,肥胖个体患 PsA 的风险更高,而孟德尔随机化研究将儿童肥胖、胰岛素抵抗和血脂异常与 PsA 联系起来。减肥干预措施已被证明可以减少 PsA 的疾病活动。此外,MetS 对肿瘤坏死因子抑制剂 (TNFi) 药物治疗 PsA 的疗效产生负面影响。用于 PsA 的药物也可能影响构成 MetS 的疾病。来氟米特已被证明可以减轻体重,但也会增加血压。TNFi药物会导致体重增加,但会降低心血管风险。Janus激酶抑制剂可增加高危人群的血脂水平和心血管风险。抗 IL-17 和抗 IL-12/IL-23 药物可能导致心血管风险的短期增加,但长期影响尚未确定。减肥代表了 PsA 疾病改变的一种未探索的途径,同时还有大量的一般健康益处。饮食和运动调整是体重管理的基石,但因人而异。
研究结论: 治疗体重减轻的新疗法,如胰高血糖素样肽 1 激动剂和钠-葡萄糖协同转运蛋白 2 抑制剂,可能被证明与疾病改善疗法一起对 PsA 和 MetS 患者有用,应作为潜在的治疗辅助手段进行研究。


4.国学者文章介绍(四)


文章题目:UK Biobank和Fragrance研究中VLDL-C和ApoB的不一致性分析:一项前瞻性观察性研究
研究内容: 最近的观察性和孟德尔随机化分析报告了极低密度脂蛋白胆固醇(VLDL-C)对风险的显著影响,与ApoB无关。在英国生物样本库和Frachial Heart研究队列中确定VLDL-C和ApoB与新发心血管事件风险的独立相关性。
研究方法:我们纳入了294289名英国生物银行参与者,中位年龄为56岁,42%为男性,2865名心脏研究参与者(中位年龄为52岁; 47%为男性)。根据ApoB回归VLDL-C得到的残差表示ApoB无法解释的VLDL-C部分,而根据VLDL-C回归ApoB得到的残差表示VLDL-C无法解释的ApoB部分。针对残余VLDL-C和残余ApoB,创建动脉粥样硬化性心血管疾病发生率的考克斯比例风险模型。模型进行了分析,有和没有高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)。此外,我们还研究了考虑ApoB和HDL-C后VLDL-C的独立效应以及考虑ApoB和VLDL-C后HDL-C的独立效应。
研究结果:在英国生物样本库中,ApoB与VLDL-C高度相关(r=0.70; P<0 id=48><0 id=49>P<0 id=50>P<0 id=51>P =0.029)。HDL-C的独立效应(考虑ApoB和VLDL-C后)仍然稳健(HR,0.86; <0 id=53>P =0.029)。所有结果在Frachial队列中一致。
研究结论:校正HDL-C后,VLDL-C与心血管风险的相关性不再具有临床意义。我们的残差不一致性分析表明,对HDL-C的调整不容忽视。



其他一、二区文章:
中国学者

外国学者

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