【合成经验】LCMS监测没发现产物分子量,别急着判断反应失败!分析一下LCMS离子片段峰!

学术   科学   2025-01-01 08:19   上海  

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常见的离子片段
正模式
原因
M+1
[M+H]+
M+14
在LCMS中羧酸与甲醇成酯,或其他多一个碳的情况
M+18
[M+NH4]+
M+19
水合
M+23
[M+Na]+
M+33
[M+CH3OH+H]+
M+39
[M+K]+
M+42
[M+CH3CN+H]+
M+64
[M+CH3CN+Na]+
2M+1
二聚+氢离子,倍峰
2M+23
二聚+钠离子
一系列相差42的峰
可能为石蜡油污染
一系列相差44的峰可能为聚乙二醇污染
M-16
[M-NH2]+(多见于苄胺,烯丙胺,苯甲酰胺)
M-17
[M-OH]+(多见于苄醇,烯丙醇,苯甲酸)
M-31
[M-OCH3]+(多见于苯甲酸甲酯)
M-35
[M-Cl]+(多见于苄氯或烯丙基氯)
M-44
羧酸和含Cbz的分子常见,重排后脱CO2
M-45
[M-OCH2CH3]+(多见于苯甲酸乙酯)
M+1-56
含Boc的分子常见,脱叔丁基片段
M-79
[M-Br]+(多见于苄溴或烯丙基溴)
M+1-100
含Boc的分子常见,脱Boc片段
M-127
[M-I]+(多见于苄碘或烯丙基碘)
(M+2)/2
分子络合两个氢离子,半峰

负模式
原因
M-1[M-H]-
M+X
[M+X]-,  X=溶剂或缓冲溶液的阴离子
M+S-1
[M+S-H]-,  S=溶剂


LCMS监测分子量时,苄位的氨基,羟基,卤原子都很容易打断,分子量出苄基正离子的分子量,因为苄基正离子的分子量和消除生成烯烃的分子量正模式M+H的值是一样的,不要误判为产物消除成了烯烃,可以通过核磁进一步表征。另外苯甲酸和苯甲酸酯,也会出打断羟基和烷氧基后的正离子的分子量。

烯丙位取代的化合物和苄基的结构类似,因此也有类似现象,在分析此类化合物的质谱时,要留意。

在分析LCMS图谱时,通常一个特定峰的离子流图谱中,不止一种片段峰,我们在分析时可以相互印证,帮助我们判断反应是否成功。比如我们在做Boc保护的反应【叔丁氧羰基保护氨基】时,分析其LCMS图谱,看到出原料分子量[M+1]+的峰,我们不要武断的认为其就是原料,要仔细分析这个峰对应的MS图谱中是否有[M+100+1]+或[M+100+Na]+的很小的碎片峰, 只要有一点非常微小的片段,那大概率这个峰应该是上Boc后的产物峰而不是原料。

【合成必备知识】LCMS基础


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