NAR| “力”与“微”:微生物DNA嵌插剂的单分子新探

文摘   2024-08-30 22:29   新加坡  

       在浩瀚的微生物世界中,隐藏着无数神秘的生物活性分子,它们仿佛微生物自我防御的“隐形墨水”,在不经意间影响着我们生活的方方面面。你是否曾经想过,这些微观生物体内潜藏的力量,能够直接改变癌症治疗的进程?DNA嵌插剂(DNA-intercalating agents),作为一种独特的抗癌药物,正是这样一种隐藏的利器。然而,发现这些分子,尤其是那些微弱却潜力无穷的新型嵌插剂,却一直是科学家们面对的难题。

神秘的DNA嵌插剂:从过去到现在

      自20世纪中期以来,DNA一直是抗癌药物的主要目标之一。许多著名的抗生素和抗癌药物,如阿克拉霉素D(Actinomycin D)和阿霉素(Doxorubicin),都是DNA嵌插剂。它们通过将芳香环结构嵌入DNA碱基对之间,扰乱了DNA复制和RNA转录等基本生命过程。然而,随着时间的推移,药物耐药性问题日益严重,新型DNA嵌插剂的发现变得愈发紧迫。

      微生物,作为自然界中生物活性分子的重要来源,能够生产出各种次级代谢产物,其中不乏具有抗癌潜力的DNA嵌插剂。然而,传统的检测方法往往要求大规模发酵和纯化过程,耗时耗力,并且容易忽略那些产量低、结合力弱的嵌插剂分子。因此,科学界亟需一种敏感度高、特异性强的新方法,能够直接从复杂的微生物培养物中检测出这些隐藏的珍宝。

单分子层面的突破:SMSA技术的应运而生

     为了应对这一挑战,来自华中科技大学的Cai Xaiofeng教授团队提出了一种创新的单分子拉伸分析技术(SMSA, single-molecule stretching assay)。这一方法直接作用于微生物培养物或其提取物,能够在微量样本中(仅5微升)灵敏地检测DNA嵌插剂。这项技术基于dsDNA在高力条件下的独特变化,能够通过检测DNA轮廓长度和过度伸展转变的变化,准确识别出嵌插剂分子,避免了繁琐的纯化步骤。

     蔡教授的团队展示了SMSA的惊人优势:通过对dsDNA施加外力,不仅提高了结合亲和力Ka,还增加了嵌插剂的插入数量,极大地提高了对弱嵌插剂的检测灵敏度。传统方法往往忽视了这些潜在的治疗剂,而SMSA则成功地捕捉到了它们的存在。

亮点解析:SMSA技术的四大突破

  1. 直接检测,省时省力:SMSA能够直接从微生物培养物中检测DNA嵌插剂,无需冗长的纯化步骤。这意味着,科学家可以在更短的时间内筛选出更多潜在的抗癌分子。

  2. 高灵敏度,弱嵌插剂无所遁形:通过对DNA施加外力,SMSA显著提高了对弱嵌插剂的检测能力,成功识别出了传统方法难以捕捉的分子。

  3. 广泛适应性,复杂样本轻松处理:无论是含有多种代谢产物的微生物培养物,还是复杂的环境样本,SMSA都能够有效处理,展现出了广泛的应用前景。

  4. 实际应用,助力新药发现:蔡教授团队利用SMSA技术,成功识别了两种DNA嵌插剂产生菌株,并分离出了三种具有抗癌活性的嵌插剂分子。尤其值得一提的是,其中的两种弱嵌插剂在抗癌实验中展现出了显著的效果。

未来展望:SMSA开启新篇章

这项研究不仅为DNA嵌插剂的发现提供了一个全新的视角,更为未来新药的开发铺平了道路。通过SMSA技术,科学家们能够更快、更精准地筛选出潜在的药物分子,为解决癌症等重大疾病提供新的希望。或许,在不久的将来,更多隐藏在微生物世界中的“隐形墨水”将被我们揭示,为人类健康保驾护航。

文字写作:feng
责任编辑:er不er
文章编号:214
论文链接:https://academic.oup.com/nar/advance-article/doi/10.1093/nar/gkae746/7743101?searchresult=1

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