Nge FJ, et al. (2024). Complete genus-level phylogenomics and new subtribal classification of the pantropical plant family Annonaceae. TAXON, doi: 10.1002/tax.13260.
（2024年10月9日发表）
摘要参考翻译：番荔枝科（Annonaceae）是一个重要的热带植物科，在世界热带雨林中尤为多样化。尽管该科的分类和系统学在过去十年中得到了显著改进，但最近的分类基于较少的质体标记和不完整的属级分类采样。该分类承认了4个亚科和20个族。然而，若干重要问题依然存在，尤其是非洲的Meiocarpidium属的系统发育位置、Malmeoideae亚科内族际关系的解决、包括23个属的多样化Miliuseae族的分类问题，以及藤本Artabotrys属在核基因与质体数据中的对比位置差异。在此，我们首次使用先前发布的番荔枝科特异性nuclear bait试剂盒，基于373个位点生成了该科的完整属级（108个分类单元）系统发育基因组树。研究表明，Meiocarpidium是Ambavioideae的姐妹群，应视为一个族，而不是独立的亚科。Artabotrys被确认为属于Duguetieae族，而非基于质体数据推断的Xylopieae族，并与另外两个非洲藤本属Letestudoxa和Pseudartabotrys为姐妹群。最终，我们成功解决了Malmeoideae亚科内的族际关系以及Miliuseae族内的大部分关系。然而，我们在该族的主干上发现了强烈的基因冲突，可能与其起源时的快速分化有关，导致了显著的不完全谱系排序。我们认为，这种冲突将难以解决。基于这一新的系统发育基因组框架，我们确认了25个亚族，其中21个为新亚族，以改进番荔枝科的亚科内分类。
基于concatenated IQ-TREE分析的番荔枝科的系统发育
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