肿瘤学研究丨第6期. 肿瘤细胞动物造模(四)

文摘   科学   2024-11-24 20:29   北京  

往期回顾丨肿瘤学研究系列

第1期. 抗肿瘤药物细胞水平研究策略
第2期. 肿瘤细胞系的选择
第3期. 肿瘤细胞动物造模(一)
第4期. 肿瘤细胞动物造模(二)
第5期. 肿瘤细胞动物造模(三)


在前面的几期推送中,我们和大家一起对于常见肿瘤细胞系的选择、原代细胞提取、抗肿瘤药物细胞水平研究策略进行了初步了解,对于肿瘤学研究基本的细胞实验做了简单梳理。接下来的内容中我们分4期进行研究动物模型部分的分享。本期推送主要内容是如何合理呈现肿瘤动物模型的数据?”

通过往期推送,我们已经对于实验动物肿瘤模型要做什么以及如何做进行了较为详尽的介绍。和大多数基础实验一样,动物肿瘤模型的构建是一件耗时费力的事情,作为肿瘤学研究——肿瘤细胞动物造模系列的最后一期推送,我们将解决实验动物肿瘤模型的最后一个问题——数据呈现,并总览整个系列的内容。



01

数据记录与整理


首先要确认一个问题:我的实验方案是论证逻辑严谨+目前技术可行+实验动物最少的最优解吗?如果没有问题就可以开始进行少量预实验,练习操作技能并通过预实验结果完善实验设计。在开始实验前,我们就要做好数据记录和整理的准备工作:


例如先整理出一个大致的记录表格,开始实验后每次处理结束后的状态/死亡数量/饮食情况、常规记录体重/血压/皮下瘤大小等。



取材时要注意轻柔剥离肿瘤和其他组织,用PBS清洗肿瘤上的血凝块和动物毛发,滤纸擦干后方可称重。拍照时按照先对照组后实验组的原则,将组织按分组从左到右由上至下依次排列在干净的背景板上,各组织方向、角度、间隔尽量保持一致,尺子要将刻度完全暴露。


另外,有包膜的脏器需要将包膜清理干净,胃肠道取材需清理内容物,肝转移瘤取材需摘除胆囊。


附《肿瘤细胞动物造模(二)》中“小鼠脾注射肝转移瘤模型”后续取材不太完美的原始图片,仅作参考



02

数据分析与可视化


得到原始数据后,根据实验设计的统计指标简单分析即可得到结果,可视化的具体形式可根据实验设计呈现。但需要注意的是,哪怕无差别的结果也是有意义的,可以根据结果调整实验设计、扩大样本量、尝试多种分析方法,但一定不要刻意为了追求实验结果“挑选数据”。


另外,由于存在实验动物意外死亡、同一模型不同批次造模、多种模型结合论证、不同实验人员操作差异等问题,我们在后期分析数据的时候可能会面临异常值、缺失值、标准化的问题。解决方法大家可以观看“开心doctor”的公开课《医学研究的数据清洗与R实战》进一步探索。(链接)当然,一般而言基础研究的数据量会明显少于组学研究,但数据清洗的思维是一致的。



结束语

作为筚路蓝缕科研生活中难得的正反馈,我们很高兴能和大家一起走完“肿瘤学研究”的一小段路程。在不断的写作过程中,我们不光梳理了自己的研究思维,也收获了分享的快乐,我们非常感谢各位观观老师的团队协作,更感谢一直以来关注我们的各位朋友们。


在“肿瘤学研究”的后续推送中,除了实验方法,我们可能会逐渐尝试实验设计、文献速览、热点追踪的内容,如果大家还有更好的想法欢迎在评论区留言。


愿我们能成为彼此的科研引路人,每天进步一点点,让你我的科研有迹可循。各位友友们加油呀!


期待已久~

基础科研交流群来啦!



注:交流群容量有限,已经在1-4群的小伙伴不用重复加了哦~

若上方群满,请添加下方微信

备注:“医学基础科研_互助交流群” 


写在最后


“观科研”(点击进一步了解我们吧)是由一群北京协和医学院(清华大学医学部)的博士开创的公众号,初心是让医学科研有迹可循,帮助一线的医学科研人员更快地成长,希望大家支持与关注!

如果大家对分享医学科研知识感兴趣,特别欢迎加入我们,期待与您的相遇相识相知,也非常欢迎大家自主投稿,如果您有需要分享的内容或对我们有任何建议,可通过后台留言、公众号菜单栏“更多—读者的话”栏目进一步了解)或发送邮件至mascu_forever@163.com与我们交流并留下个人联系方式,我们会及时与您联系。

如果您觉得我们长期的干货推送对您的科研工作有所帮助,可以在合适的机会致谢(包括但不限于SCI论文、毕业论文等),格式如下:

The authors thank the support of Skill Learning from Kaixin Doctor and MASCU (Medical Association with Science, Creativity, and Unity), Inc, Shenzhen, China (mascu_forever@163.com).



【大家的支持,是我们持续更新的动力!】


Pay attention!
微信公众号的推送规则发生改变(不再按照时间顺序来显示),如果没有将“观科研”设置为星标,你就可能错失里面的精彩推送。


点击“在看”,可参与讨论哦!

图文:通观

审核:遐观

编辑:往观

编审:静观

观科研
让医学科研有迹可循
 最新文章