科研配色『单细胞测序专栏』 | 第8期. 顶刊配色方案让拟时序分析不再单调!快来抄作业~

文摘   教育   2024-11-07 19:01   北京  




【拟时序分析】是研究生物体内单个细胞之间的差异和相似性、以及它们如何发育成为不同的类型和功能的一种重要工具。

上周我们分享了弦图配色方案(科研配色『单细胞测序专栏』 | 第7期 火山图配色远不止红蓝!让审稿人眼前一亮的火山图都在这里!)。在第8期,我们又从CNS顶刊中收集了8组拟时序分析配色方案,期望斑斓的色彩不仅能为您的学术文章增添一抹亮色,也能给予即将到来的寒冬一丝温暖。岁至立冬,日月柔软,顺祝冬安!

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01

三色配色

Three color scheme










02

多色配色

Multi-color scheme







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参考文献:

1. Phong D. Nguyen et al. ,Interplay between calcium and sarcomeres directs cardiomyocyte maturation during regeneration. Science 380,758-764(2023).DOI:10.1126/science.abo6718
2. Kyle J. Gellatly et al. ScRNA-seq of human vitiligo reveals complex networks of subclinical immune activation and a role for CCR5 in Treg function. Sci. Transl. Med.13,eabd8995(2021).doi:10.1126/scitranslmed.abd8995
3. Tang F, Li J, Qi L, et al. A pan-cancer single-cell panorama of human natural killer cells. Cell. 2023 Sep 14;186(19):4235-4251.e20. doi: 10.1016/j.cell.2023.07.034.
4. Liu ZL, Meng XY, Bao RJ, et al. Single cell deciphering of progression trajectories of the tumor ecosystem in head and neck cancer. Nat Commun. 2024 Mar 22;15(1):2595. doi: 10.1038/s41467-024-46912-6.
5. Lee, S.H., Kim, N., Kim, M. et al. Single-cell transcriptomics reveal cellular diversity of aortic valve and the immunomodulation by PPARγ during hyperlipidemia. Nat Commun 13, 5461 (2022). https://doi.org/10.1038/s41467-022-33202-2

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图文:仓观

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