科研配色『单细胞测序专栏』 | 第7期. 火山图配色远不止红蓝!让审稿人眼前一亮的火山图都在这里!

文摘   教育   2024-10-25 19:04   北京  




火山图(Volcano plot)是散点图的一种,将统计显著性量度(如p-value)和变化幅度相结合,从而能够帮助快速直观地识别变化幅度较大且具有统计学意义的数据点。

上周我们分享了弦图配色方案研配色『单细胞测序专栏』 | 第6期. 顶刊偏爱的弦图配色是这样的!当糖果配色与复古配色撞个满怀~)。在第7期,我们又从CNS顶刊中收集了8组火山图配色方案,既有经典的红蓝色系,又有不落窠臼的小清新风格。

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01

经典红蓝配色

Red & Blue










02

五彩多巴胺配色

Dopamine









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参考文献:

1.Kyle J. Gellatly et al. ScRNA-seq of human vitiligo reveals complex networks of subclinical immune activation and a role for CCR5 in Treg function. Sci. Transl. Med.13,eabd8995(2021).doi:10.1126/scitranslmed.abd8995
2.Tang F, Li J, Qi L, et al. A pan-cancer single-cell panorama of human natural killer cells. Cell. 2023 Sep 14;186(19):4235-4251.e20. doi: 10.1016/j.cell.2023.07.034.
3.Liu ZL, Meng XY, Bao RJ, et al. Single cell deciphering of progression trajectories of the tumor ecosystem in head and neck cancer. Nat Commun. 2024 Mar 22;15(1):2595. doi: 10.1038/s41467-024-46912-6.
4.Lee, S.H., Kim, N., Kim, M. et al. Single-cell transcriptomics reveal cellular diversity of aortic valve and the immunomodulation by PPARγ during hyperlipidemia. Nat Commun 13, 5461 (2022). https://doi.org/10.1038/s41467-022-33202-2
5.Hu Zeng et al. Spatially resolved single-cell translatomics at molecular resolution. Science 380,eadd3067(2023).DOI:10.1126/science.add3067
6.Piehl N, van Olst L, Ramakrishnan A, et al. Cerebrospinal fluid immune dysregulation during healthy brain aging and cognitive impairment. Cell. 2022 Dec 22;185(26):5028-5039.e13. doi: 10.1016/j.cell.2022.11.019.

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