往期回顾
在前几期的Western blot曝光及数据展示的学习后(图解WB | 第5期. Western blot蛋白条带位置异常?先别慌!),以及图解wb原始数据存储(图解原始数据 | 第1期. 原始数据整理策略您想要的应有尽有),不少同学已经学会wb的相关操作和数据分析啦!但是在投稿文章时,杂志可能要求你提供wb原始数据,不少同学可能犯了难,难以回溯到文章使用的wb代表图及统计用的的原始图,究其原因,是未将数据存储做到位。
今天就将分享给大家如何一站式完成wb的数据存储,以便未来统计分析和快速提供原始数据。
No.1 通用步骤
General Steps
1. 存储原始数据。
2. 整理本次WB数据(涵盖带Marker的合成图,曝光信息等PPT),并做统计。
3. 本次WB实验,纳入该实验统计分析的统计量,汇总到该实验目录下的总表。
No.2 具体步骤
Specific Steps
1. 存储原始数据。曝光完成后,存储原始数据(至少两处,电脑及硬盘或网盘),命名可自定义,通常以时间命名。如:20240701。
2. 整理原始数据文件。以组织或细胞分类的文件夹,新建以“刺激条件”的子文件夹,如RAW264.7细胞过表达P53,则在“细胞”文件夹下,新建“RAW264.7细胞过表达P53”文件夹,并在其中新建该实验刺激条件下的“统计-汇总”文件夹,用于汇总统计。
将本次20240701的原始数据导入,不同时间或不同批次跑的“RAW264.7细胞过表达P53”实验均放于此处(如下图所示)。
3. 整理本次WB数据。本次WB数据的整理,新建“导出数据”文件夹,将整理后的一切图片和统计,均放于此。
该文件夹里面可包含三部分内容:①图片;②统计;③merge后的wb图片制作的PPT。
PPT里的内容应包含膜曝光的所有蛋白及内参,细胞及刺激条件等,如下图所示
4. 汇总数据。本次WB实验可纳入最后的统计分析的统计量,需汇总到总表中。如下图所示,20240701两个统计量可纳入最后的统计。下次再做相同条件的WB实验,若也纳入最终统计,在右侧标记时间和膜的标号和对应的灰度值即可。
如果你每做一次WB实验之后都完成以上几步,你就会发现,下次回过头找原始图片和对应统计数据时会轻松很多!你学会了吗?
以上学习内容,仅供大家参考。大家对于推送内容有任何问题或建议可以在公众号菜单栏“更多--读者的话”栏目中提出,我们会尽快回复!
期待已久~
基础科研交流群来啦!
注:交流群容量有限,已经在1-4群的小伙伴不用重复加了哦~
若上方群满,请添加下方微信
备注:“医学基础科研_互助交流群”
写在最后
“观科研”(点击进一步了解我们吧)是由一群北京协和医学院(清华大学医学部)的博士开创的公众号,初心是让医学科研有迹可循,帮助一线的医学科研人员更快地成长,希望大家支持与关注!
如果大家对分享医学科研知识感兴趣,特别欢迎加入我们,期待与您的相遇相识相知,也非常欢迎大家自主投稿,如果您有需要分享的内容或对我们有任何建议,可通过后台留言、公众号菜单栏“更多—读者的话”栏目(进一步了解)或发送邮件至mascu_forever@163.com与我们交流并留下个人联系方式,我们会及时与您联系。
The authors thank the support of Skill Learning from Kaixin Doctor and MASCU (Medical Association with Science, Creativity, and Unity), Inc, Shenzhen, China (mascu_forever@163.com).
【大家的支持,是我们持续更新的动力!】
图文:围观
审核:静观
编辑:往观
编审:静观