图解原始数据 | 第3期. Western blot数据存储的一站式流程

文摘   科学   2024-07-03 19:51   北京  

往期回顾

图解原始数据 | 第1期. 原始数据整理策略您想要的应有尽有
图解原始数据 | 第2期. 简单流式分析入门操作


在前几期的Western blot曝光及数据展示的学习后图解WB | 第5期. Western blot蛋白条带位置异常?先别慌!),以及图解wb原始数据存储(图解原始数据 | 第1期. 原始数据整理策略您想要的应有尽有),不少同学已经学会wb的相关操作和数据分析啦!但是在投稿文章时,杂志可能要求你提供wb原始数据,不少同学可能犯了难,难以回溯到文章使用的wb代表图及统计用的的原始图,究其原因,是未将数据存储做到位。


今天就将分享给大家如何一站式完成wb的数据存储,以便未来统计分析和快速提供原始数据。


No.1 通用步骤

General Steps

1. 存储原始数据。


2. 整理本次WB数据(涵盖带Marker的合成图,曝光信息等PPT),并做统计。


3. 本次WB实验,纳入该实验统计分析的统计量,汇总到该实验目录下的总表。


No.具体步骤

Specific Steps

1. 存储原始数据。曝光完成后,存储原始数据(至少两处,电脑及硬盘或网盘),命名可自定义,通常以时间命名。如:20240701。


2. 整理原始数据文件。以组织或细胞分类的文件夹,新建以“刺激条件”的子文件夹,如RAW264.7细胞过表达P53,则在“细胞”文件夹下,新建“RAW264.7细胞过表达P53”文件夹,并在其中新建该实验刺激条件下的“统计-汇总”文件夹,用于汇总统计。


将本次20240701的原始数据导入,不同时间或不同批次跑的“RAW264.7细胞过表达P53”实验均放于此处(如下图所示)。

3. 整理本次WB数据。本次WB数据的整理,新建“导出数据”文件夹,将整理后的一切图片和统计,均放于此。

该文件夹里面可包含三部分内容:①图片;②统计;③merge后的wb图片制作的PPT。

PPT里的内容应包含膜曝光的所有蛋白及内参,细胞及刺激条件等,如下图所示

4. 汇总数据。本次WB实验可纳入最后的统计分析的统计量,需汇总到总表中。如下图所示,20240701两个统计量可纳入最后的统计。下次再做相同条件的WB实验,若也纳入最终统计,在右侧标记时间和膜的标号和对应的灰度值即可。



如果你每做一次WB实验之后都完成以上几步,你就会发现,下次回过头找原始图片和对应统计数据时会轻松很多!你学会了吗?



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