登上Nature!这次直接分割一切医学图像!基于sam的医学图像分割模型

文摘   科技   2024-03-01 20:05   湖南  

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医学图像分割再次登上 Nature communications,这次直接分割一切医学图像!

MedSAM 是一种改进的基础模型,可显著增强 SAM 在医学图像上的分割性能。

并且该模型已经开源

论文地址:

https://www.nature.com/articles/s41467-024-44824-z#Sec2

项目地址:

https://github.com/bowang-lab/MedSAM


MedSAM是在一个大规模医学图像数据集上开发的,该数据集包含 1,570,263 个图像掩模对,涵盖 10 种成像模式和 30 多种癌症类型。



作者通过内部验证和外部验证评估了 MedSAM。内部验证包含 86 个分割任务,外部验证包括 60 个分割任务

结果表明 MedSAM 在大多数任务上都排名第一超过了 U-Net 和DeepLabV3+ 专业模型的性能而基础模型 sam 几乎所有任务都是垫底。



这意味着医学图像分割落地应用的可行性,也证明这个领域在接下来的很长时间中都会是热门研究领域。



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并且 MedSAM 还可以提升标注效率,作者进行了人工注释研究来评估两个管道的时间成本。

对于第一个管道,两名人类专家以逐片方式手动注释 3D 肾上腺肿瘤。

对于第二条流程,专家们首先每隔3-10片用线性标记(初始标记)绘制肿瘤长轴和短轴,这是肿瘤反应评估的常见做法。

然后,使用 MedSAM 根据这些稀疏线性注释对肿瘤进行分割。

结果表明,在 MedSAM 的帮助下,两位专家的注释时间分别大幅减少了 82.37% 和 82.95%。



尽管 MedSAM 拥有强大的功能,但它也存在一定的局限性。



但是这些限制并没有削弱 MedSAM 的实用性,具体信息大家可以仔细阅读原文。


— 完 —
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