王凌华教授（Linghua Wang）是全美最大的癌症中心MD安德森癌症中心基因组医学系的终身教职副教授，同时也是计算生物学实验室的负责人。她在计算生物学、肿瘤基因组学、免疫肿瘤学以及单细胞和空间多组学等领域拥有深厚的专业知识，并领导着一个以计算生物学研究为主的综合实验室。
王凌华教授的团队应用先进的单细胞测序和空间多组学技术，并结合创新的生物信息学分析方法，深入剖析肿瘤细胞及其微环境的异质性、表型可塑性、细胞互作和动态演变。
一、2024年2月发表在《Nature》（IF:50.5），首年开门红！
“肺腺癌上皮细胞状态和可塑性图谱，An atlas of epithelial cell states and plasticity in lung adenocarcinoma”
该研究绘制了肺腺癌上皮细胞可塑性图谱，分析了来自16例早期LUAD和47个匹配的正常肺样本的246,102个单上皮细胞
鉴定出KRT8肺泡中间细胞（简称KACs）是与LUAD发病高度相关的中间肺泡细胞亚群，这些细胞分化减少、可塑性增加，并携带驱动KRAS突变。KACs的表达谱在肺前癌细胞和LUAD细胞中富集，并预示着较差的生存率。在暴露于烟草致癌物的小鼠中，KACs在肺部肿瘤出现之前就已经存在，并在致癌物暴露停止后持续数月。此外，它们获得了Kras突变，并在源自肺泡II型（AT2）细胞的KAC富集类器官中对靶向KRAS抑制敏感。最后，AT2细胞或KRT8细胞在致癌物暴露后的谱系标记显示，KACs可能是AT2向肿瘤细胞转化的中间状态。
这项研究为LUAD 发生根源的上皮细胞类型提供了新见解，有助于确定预防该疾病的可操作靶标和策略。
二、2024年8月发表在《Gastroenterology》（IF:25.7），梅开二度！
“转移性胃癌图谱将铁死亡与疾病进展和免疫治疗反应联系起来，Atlas of Metastatic Gastric Cancer Links Ferroptosis to Disease Progression and Immunotherapy Response”
文章对68例配对的、未接受过治疗的原发性转移性肿瘤进行了深入的单细胞转录组和免疫分析，以描绘转移进展过程中癌细胞及其肿瘤微环境的改变。为了验证观察结果，作者还使用细胞系和多种患者来源的异种移植物和GAC 的新型小鼠模型进行了体外和体内的综合功能研究。
肝脏和腹膜转移在癌细胞和肿瘤微环境表型的动力学中表现出不同的特性，支持癌细胞及其局部肿瘤微环境在转移部位共同进化的观点。该研究还揭示了跨转移瘤的癌症元程序的差异激活。作者团队观察到在GAC进展过程中通过GPX4 上调逃避癌细胞铁死亡。Gpx4 的条件性耗竭或铁死亡耐药的药物抑制显着减轻了肿瘤生长和转移进展。此外，铁死亡再敏化治疗增强了嵌合抗原受体 T 细胞疗法的疗效。
这项研究代表了迄今为止最大的转移性GAC单细胞数据集。GAC转移分子和细胞动力学的高分辨率图谱揭示了靶向铁死亡防御与嵌合抗原受体T细胞疗法相结合的基本原理，作为一种具有潜在巨大临床意义的新型治疗策略。这样的研究可以更深入地理解GAC转移中癌细胞及其肿瘤微环境（TME）的演变，可能为临床转化开辟新的途径。
三、2024年8月发表在《Nat Rev Mol Cell Biol》（IF:81.3），文体双开花，研究综述“一起”发！
“使用单细胞和空间转录组学分析细胞身份和组织结构，Profiling cell identity and tissue architecture with single-cell and spatial transcriptomics”
在这篇综述中，作者讨论了识别和表征细胞状态及多细胞邻域的最新进展、当前挑战和未来展望，同时还讨论了样本处理、数据整合、微妙细胞状态识别、轨迹建模、反卷积和空间分析方面的最新进展等方向。以及深度学习，包括基础模型等，并探讨了这些工具在干细胞生物学、免疫学和肿瘤生物学领域的最新应用，以及单细胞和空间转录组学在生物研究和其向临床转化中的未来。
单细胞转录组学和空间转录组学技术正在彻底改变我们对复杂组织中细胞状态的起源、调控和维持的理解。通过精心的实验设计和计算方法的战略性应用，研究人员能够充分利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）和空间转录组（ST）数据，揭示在多种情境下关键的细胞状态和多细胞群落。尽管数据分析存在固有挑战，但迅速涌现的实验和计算工具，以及像人类细胞图谱（Human Cell Atlas）、人类蛋白质图谱（Human Protein Atlas）和人类肿瘤图谱网络（Human Tumor Atlas Network）这样的大型合作项目，正在促进这些细胞状态在更广泛的人类健康和疾病谱系中的情境化。随着来自不同组织、物种和条件的大量基因组、空间和时间数据的整合，人类才刚刚开始揭开细胞的奥秘。
四、2024年11月发表在《Nat Immunol》（IF:27.7），锦上添花，再添新星！
“免疫检查点治疗的下一代联合方法，Next-generation combination approaches for immune checkpoint therapy”
免疫检查点疗法彻底改变了癌症治疗，为部分患者带来了显著的临床效果。然而，许多患者在免疫检查点治疗后并未经历持久的反应，这是由于多种耐药机制的存在，这强调了需要有效的联合策略来针对这些耐药途径并改善临床反应。基于对调节人类抗肿瘤免疫反应的复杂生物学的理解，发展联合策略一直是一个重大挑战。
在这篇综述中描述了当前联合疗法的现状。还讨论了开发有效的联合策略将需要整合小型、富含组织的临床试验，以确定治疗驱动的人类免疫系统扰动如何影响下游生物学反应和最终的临床结果，将临床观察反向翻译到免疫能力完整的临床前模型，以探究特定生物学途径及其对抗肿瘤免疫反应的影响，以及新颖的计算方法和机器学习，以整合跨临床和临床前研究的多个数据集，识别需要针对成功联合策略的最相关途径。
王凌华教授在医学研究中不断耕耘，24年一整年，王教授的研究成果真是硕果累累，发表的多篇高质量学术论文，为医学领域的发展做出了重要贡献。她的高产和卓越表现，无疑是对“高调做事”理念的最好诠释，让人由衷地感到敬佩。
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