诺奖风头正劲,microRNA测序早做早发文——医学篇

企业   2024-11-26 17:20   天津  


2024年10月7日,诺贝尔生理学或医学奖授予了microRNA(miRNA)的发现者,这一殊荣使miRNA迅速成为科研领域的研究热点。miRNA是一类长度约为21至25个核苷酸的RNA分子,通过与目标mRNA的3'非翻译区(3' -UTR)结合,调控基因表达,通常通过抑制翻译或促进mRNA降解来实现。miRNA在细胞发育、增殖、分化和凋亡等生物过程中发挥重要作用,并与多种疾病(如癌症、心血管疾病和神经退行性疾病)的发生和发展密切相关。miRNA的研究不仅有助于解析基因调控网络,还具有巨大的临床应用前景。

诺禾致源在miRNA测序领域已深耕数十载,积累了丰富的物种和组织项目经验。迄今为止,诺禾致源已助力科研工作者在《Nature Genetics》《Nature Communications》等高水平杂志上成功发表了160余篇文章,累计影响因子高达1200分!接下来,小诺将为大家分享几篇microRNA医学研究的项目文章。



项目文章一

AMPK上调的microRNA-708通过下调DAB2基因表达和抑制mTORC1的激活,发挥细胞衰老和机体老化抑制因子的作用


AMPK-upregulated microRNA-708 plays as a suppressor of cellular senescence and aging via downregulating disabled-2 and mTORC1 activation[1]

MedComm

10.7

2024年3月

smallRNA测序

与衰老相关的microRNAs(SA-miRNAs)是调控衰老性状的重要分子。虽然已经鉴定了许多促进衰老的SA-miRNAs,但证实抑制衰老的SA-miRNAs很少,这阻碍了我们对衰老调控的全面理解。本研究中,证实了miR-708在衰老细胞和衰老组织中的表达降低,miR-708过表达可以缓解细胞的衰老,并发现miR-708能直接靶向DAB2基因的3‘UTR并抑制其表达。有趣的是,miR-708引起的DAB2下调阻断了哺乳动物雷帕霉素复合物1(mTORC1)靶点的异常激活,这是衰老进程中的关键驱动性代谢事件,同时还能使受损的自噬现象得以恢复,这是mTORC1异常激活的下游事件。还发现,amp活化蛋白激酶(AMPK)的激活可以通过提高DICER的表达来上调miR-708,而miR-708抑制剂能够减弱AMPK的抗衰老作用。综上所述,本研究首次将miR-708鉴定为抑制衰老的SA-miRNA,并发现了一个新的信号级联反应,miR-708将DAB2/mTOR轴和AMPK/DICER轴连接在一起。这些发现不仅证明了miR-708在衰老调控中的潜在作用,也扩展了连接AMPK和mTORC1的信号网络。



项目文章二

微小单胞菌通过上调miR-218-5p来激活Ras/ERK/ c-Fos通路,从而促进结直肠癌的进展


Parvimonas micra activates the Ras/ERK/c-Fos pathway by upregulating miR-218-5p to promote colorectal cancer progression[2]

JOURNAL OF EXPERIMENTAL & CLINICAL CANCER RESEARCH

11.4

2023年1月

smallRNA测序、外泌体smallRNA测序

通过体外和体内实验证实微小单胞菌(P. micra)可促进结直肠癌的发展。对细菌和细胞共培养后的转录组分析显示,P. micra通过激活Ras/ERK/c-Fos通路促进细胞增殖。对细胞和外泌体的microRNA测序分析显示,miR-218-5p和蛋白酪氨酸磷酸酶受体R(PTPRR)是激活Ras/ERK/c-Fos通路的关键因素。并使用miR-218-5p抑制剂来证实该microRNA在异种移植小鼠中的作用。研究发现,P. micra通过上调细胞和外泌体中miR-218-5p的表达,抑制PTPRR的表达,最终激活Ras/ERK/c-Fos信号通路,从而促进结直肠癌的发生发展。



项目文章三

在无脑畸形中,亚甲基四氢叶酸脱氢酶 1(MTHFD1)对视黄酸受体信号传导的负调控至关重


MTHFD1 is critical for the negative regulation of retinoic acid receptor signalling in anencephaly[3]

BRAIN

10.6

2023年3月

smallRNA测序、普通转录组测序

神经管缺陷是由早期胚胎发育过程中神经管闭合失败引起的最严重的先天畸形,其潜在分子机制尚不清楚。视黄酸是维生素A的活性衍生物,对神经系统发育至关重要,在人类神经管缺陷中已观察到视黄酸受体 (RAR) 信号传导障碍。然而,神经管缺陷中视黄酸 - 视黄酸受体信号调节机制尚不完全清楚。

该研究发现,在无脑胎儿的脑组织中,视黄酸受体 γ(RARγ)的mRNA水平显著上调。通过免疫沉淀 - 质谱分析(IP - MS)技术,确定了MTHFD1是RARγ 的一个特定靶点,MTHFD1对RARγ转录因子活性起负调控作用。在人类无脑儿以及视黄酸诱导的神经管缺陷小鼠模型中,进一步确定了MTHFD1的低表达以及视黄酸受体信号的激活。作为一碳循环中的限速酶,MTHFD1可能是视黄酸受体的一种特定调节剂。这些发现为神经管缺陷病理中核叶酸代谢与视黄酸受体信号之间的功能联系提供了新的见解。












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参考文献:

[1] Zhang J, Gong H, Zhao T, et al. AMPK-upregulated microRNA-708 plays as a suppressor of cellular senescence and aging via downregulating disabled-2 and mTORC1 activation. MedComm (2020). 2024;5(3):e475. Published 2024 Mar 9. doi:10.1002/mco2.475

[2] Chang Y, Huang Z, Hou F, et al. Parvimonas micra activates the Ras/ERK/c-Fos pathway by upregulating miR-218-5p to promote colorectal cancer progression. J Exp Clin Cancer Res. 2023;42(1):13. Published 2023 Jan 10. doi:10.1186/s13046-022-02572-2

[3] Xie X, Li C, Yu J, et al. MTHFD1 is critical for the negative regulation of retinoic acid receptor signalling in anencephaly. Brain. 2023;146(8):3455-3469. doi:10.1093/brain/awad084


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