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CUT&Tag技术对乳酸化修饰的探索
文献一 CUT&Tag技术首次揭示H3K18la标记组织特异性的活性增强子
题目：H3K18 lactylation marks tissuespecific active enhancers[1]
杂志及IF：Genome Biology （IF=17.9）
测序手段：CUT&Tag、RNA-seq
研究亮点：本篇作者首次通过CUT&Tag研究H3K18la（组蛋白乳酸化）在人/鼠全基因组位置分布，发现H3K18la存在于不同代谢状态的细胞类型和组织中，不仅是启动子的标记，也是组织特异性活性增强子的标记。
文献二 CUT&Tag技术研究H3K18la对PDAC发生发展调控机制
题目：Positive feedback regulation between glycolysis and histone lactylation drives oncogenesis in pancreatic ductal adenocarcinoma[2]
杂志及IF：Molecular Cancer（IF=27.7）
测序手段：CUT&Tag、RNA-seq
研究亮点：该研究通过CUT&Tag表明PDAC中H3K18la（组蛋白乳酸化）水平升高与预后不良相关。结合RNA-seq发现H3K18la激活下游TTK和BUB1B的转录，TTK可磷酸化LDHA从而激活LDHA上调乳酸生成和H3K18la，形成糖酵解-H3K18la-TTK/BUB1B正反馈回路，为PDAC治疗提供了新思路。
题目：Histone lactylation-boosted ALKBH3 potentiates tumor progression and diminished promyelocytic leukemia protein nuclear condensates by m1A demethylation of SP100A[3]
杂志及IF：Nucleic Acids Research（IF=14.9）
测序手段：CUT&Tag、ChIP-seq、RNA-seq、MeRIP-seq
研究亮点：本研究首次揭示了m1A负责激活肿瘤抑制基因，并揭示了组蛋白乳酸化、mRNA m1A修饰以及相分离介导的凝聚物形成之间的相互作用，从而提供了一种针对性m1A重编程的新型治疗方法，用于高效治疗肿瘤。
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CUT&Tag技术对磷酸化修饰的探索
题目：Histone phosphorylation integrates the hepatic glucagon-PKA-CREB gluconeogenesis program in response to fasting[4]
杂志及IF：Molecular Cell（IF=14.5）
测序手段：CUT&Tag、ChIP-seq、RNA-seq
研究亮点：该研究通过CUT&Tag及ChIP-seq揭示了组蛋白磷酸化修饰快速响应饥饿刺激的胰高血糖素-PKA信号通路，联合RNA-seq发现可进一步促进肝脏糖异生基因转录的工作机制，丰富了对机体在染色质层面如何响应激素变化，调控代谢稳态的生物学认识。
题目：Histone H3 serine-57 is a CHK1 substrate whose phosphorylation affects DNA repair[5]
杂志及IF：Nature Communications（IF=16.6）
研究亮点：本文报道发现组蛋白H3丝氨酸57位点的磷酸化(H3S57ph)这一新的翻译后修饰标记在DNA复制过程中进入染色质，由CHK1激酶负责催化。本研究揭示H3S57ph在细胞响应DNA损伤方面的重要作用,为相关生物学过程的深入研究奠定了基础。
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参考文献
[1] GALLE E, WONG C W, GHOSH A, et al. H3K18 lactylation marks tissue-specific active enhancers[J/OL]. Genome Biology, 2022.
[2] FEI L, WENZHE S, LI X, et al. Positive feedback regulation between glycolysis and histone lactylation drives oncogenesis in pancreatic ductal adenocarcinoma[J/OL]. Molecular Cancer, 2024.
[3] XIANG G, Ai Z, JIE Y, et al. Histone lactylation-boosted ALKBH3 potentiates tumor progression and diminished promyelocytic leukemia protein nuclear condensates by m1A demethylation of SP100A[J/OL]. Nucleic Acids Research, 2024.
[4] ZHAO Y, LI S, CHEN Y, et al. Histone phosphorylation integrates the hepatic glucagon-PKA-CREB gluconeogenesis program in response to fasting[J/OL]. Molecular Cell, 2023.
[5] NiKOLAOS P, PABLO D D, et al. Histone H3 serine-57 is a CHK1 substrate
whose phosphorylation affects DNA repair[J/OL]. Nature Communications, 2023.
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