临床肿瘤科室如何哪些常见的公共数据库可以写文章？今天来个初步汇总
健康
科学
2024-07-24 11:30
浙江
想发论文但没数据，又没时间，没条件做试验，临床医生，肿瘤方面的专家学者，公卫、生信、遗传方面的学者都可以用这些公共数据库分析癌症人群数据，做到零试验发文！说到癌症人群的公共数据库，诸位最熟悉的不过是SEER数据库了吧！其实我们常见的，常用的数据库也包含了癌症人群的数据。今天我们就为大家做一个含有癌症人群数据的公共数据库汇总，当然这是不完全汇总，还请大家见谅。SEER（Surveillance, Epidemiology, and End Results）数据库是美国国家癌症研究所（NCI）创建并维护的一个综合性癌症统计数据库。它于1973 年建立，旨在收集关于癌症发病率、治疗和生存率等方面的详细信息，里面包括了各式各样的肿瘤类型，如肺癌、乳腺癌、胃癌等；还提供了各式各样的临床资料，如性别、年龄、TNM 分期等，以用于癌症流行病学研究和临床医学研究。近10年发文量：pubmed检索发文量高达22462篇官网链接：https://seer.cancer.gov/MIMIC（Medical Information Mart for Intensive Care）数据库是由麻省理工学院(MIT)与贝斯以色列女执事医疗中心(Beth Israel Deaconess Medical Center)合作开发的一个公开可访问的大型医疗数据库。该数据库包含了在贝斯以色列女执事医疗中心重症监护病房(ICU)患者的详细健康数据。尽管MIMIC数据库的主要目标是记录ICU患者的综合医疗信息，而非专门针对某一类疾病，如癌症，但由于它包含的数据量庞大且覆盖面广，包含了大量癌症患者的相关数据。获取：MIMIC数据库的数据是免费的，但是研究人员必须通过认证培训、签署并提交数据使用协议、提交访问申请获得批准即可下载数据官网链接：https://mimic.mit.edu/TCGA（The Cancer Genome Atlas，癌症基因组图谱）是由美国国立卫生研究院（NIH）和国家癌症研究所（NCI）资助创建的一个庞大的癌症基因组项目，关注与癌症的发生和发展相关的分子突变图谱，集成了多种肿瘤类型的基因数据、临床数据和图片数据。TCGA数据库汇集了来自多种癌症的DNA测序（包括全基因组测序和外显子组测序）、RNA测序、甲基化分析、拷贝数变异、单核苷酸多态性（SNP）基因分型、蛋白质表达等多种类型的数据。下载链接：https://portal.gdc.cancer.gov/近10年发文量：pubmed检索发文量26223篇GEO（Gene Expression Omnibus，基因表达数据库）是由美国国家生物技术信息中心（NCBI） 维护的公共基因表达数据资源，收录了世界各国研究机构提交的基因表达数据，主要包括肿瘤、非肿瘤、芯片、NGS、差异分析、分子验证等各种公开数据。官网链接：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/近10年发文量：pubmed检索发文量13275篇NHANES（National Health and Nutrition Examination Survey，国家健康与营养检查调查）是由美国疾病控制与预防中心（CDC）的国家健康统计中心（NCHS）开展并管理的一项重要的健康相关调查。调查的目的是评估美国成年人口和儿童的健康与营养状况，为公共政策、科研及公众健康倡议提供基础数据。NHANES始于1960年，是一项基于人群的横断面调查，自1999年以来每年对美国境内15个县约5000人各个年龄段人群进行调查。数据库内容涵盖人口学、社会经济学、膳食、健康相关的问题，以及体格检查（医学检查、口腔检查、身体测量和实验室检测）。NHANES数据库中包含针对癌症人群的数据。这些数据可以用于研究癌症的流行率、风险因素以及与其他健康指标的关系。官网链接：https://www.cdc.gov/nchs/nhanes/index.htmNHIS（National Health Interview Survey，国家健康访谈调查）是由美国国家健康统计中心（NCHS）组织执行的，自1957年开始对全美国人群进行健康相关指标的调查，目前每年发放一轮数据，每轮的人群数目在3万左右。其涵盖了社会学基础参数、健康/疾病状况、健康相关行为、医疗服务使用史等内容。对于癌症人群，有癌症类型、诊断时间、治疗方法以及癌症对健康和生活质量的影响等数据，但没有过于具体的临床指标（例如肿瘤具体分期、亚型）。官网链接：https://www.cdc.gov/nchs/nhis/HRS（Health and Retirement Study，健康与退休研究）是由美国密歇根大学社会研究所（Institute for Social Research, ISR）负责实施的一项长期纵向研究，旨在调查美国50岁及以上人群的健康、经济状况、退休和家庭结构等多个方面的信息。该研究自1992年开始，每两年进行一次数据收集。调查内容包括收入和财富、健康、意识和医疗服务使用、工作和退休以及与家人联系等内容。2006年以来数据收集扩展至生物标志物、遗传学、以及心理学和社会背景等相关内容。HRS数据库中，有癌症人群健康状况的数据，包括癌症诊断、治疗和其它健康相关信息。获取：注册后免费使用，而限制性数据需单独应用程序获取。官网链接：https://hrs.isr.umich.edu/中国健康与养老追踪调查（China Health and Retirement Longitudinal Study, CHARLS）旨在收集一套代表中国45岁及以上中老年人家庭和个人的高质量微观数据，用以分析我国人口老龄化问题，推动老龄化问题的跨学科研究。CHARLS全国基线调查于2011年开展，覆盖150个县级单位，450个村级单位，约1万户家庭中的1.7万人。这些样本以后每两到三年追踪一次，调查结束一年后，数据将对学术界展开。目前已有5期数据2011（wave 1）、2013（wave2）、2015（wave 3）以及2018（wave 4），2020（wave 5）。官网链接：https://charls.pku.edu.cn/我们团队提供“公共数据库挖掘”服务了
①公共数据库数据下载
②挖掘出具有发表级的结果
③包括SEER、NHANES、老年健康数据库、GBD数据库等
④提供规范的统计分析报告
⑤提供写作建议
联系李老师咨询（微信号sas555777）
![]()
