Anal. Chem.|Taylor – Aris扩散辅助质谱法分析天然蛋白质

文摘   科学   2024-09-21 14:12   广东  

大家好,本周为大家分享一篇2024年发表在Analytical Chemistry上的文章,Taylor−Aris Dispersion-Assisted Mass Spectrometry for the Analysis of Native Proteins1。该文章的通讯作者是来自德国德布勒森大学无机与分析化学系的Attila Gaspar教授。

非变性质谱技术是揭示蛋白质及其复合物天然结构的重要工具,它能够提供关于蛋白质组成、化学计量比、亚基排列以及与配体结合位点的详细信息。为了保持蛋白质的天然构象,通常在pH值约为7的缓冲溶液中进行电喷雾离子化(ESI)。然而,常用的缓冲体系,如PBSTri-HCl,含有大量非挥发性盐分,这些盐分会干扰蛋白质的离子化过程,抑制其信号强度。为了在质谱分析中同时保持蛋白质的天然状态并减少基质干扰,研究人员探索了多种策略。一种常见的方法是通过超滤或在线脱盐技术,将样品转移到醋酸铵缓冲液中。但这些处理过程可能会改变蛋白质的原始特性,因此,需要尽可能缩短样品处理时间。一种简便的方法是在样品中添加大量醋酸铵,以中和钠盐引起的信号抑制,或者使用特定试剂在ESI过程中实现脱盐。此外,还可以采用直径为0.5 μm的纳米喷针,通过产生更小的初始液滴来降低单位液滴中的盐分与蛋白质的比例。

本文介绍了一种创新的质谱分析技术—Taylor−Aris扩散辅助质谱(TADA-MS),该技术通过利用蛋白质与基质成分(如盐分)在扩散系数上的显著差异,实现了在不破坏蛋白质天然构象的前提下,直接从复杂基质中分析蛋白质。本研究中,研究者们选用了多种蛋白质样品,包括治疗性抗体、肌红蛋白、血红蛋白和Concanavalin A等,以验证TADA-MS技术的有效性。如1所示,通过TADA-MS技术,研究者们能够直接从药物的配方缓冲液中分析治疗性抗体Ramucirumab。在毛细管内的层流状态下,大分子抗体(>150 kDa)与小分子盐分实现了分离,其中抗体主要集中在流束的前部和尾部。前部的质谱(1a)信号清晰且易于评估,表明该区域含有纯度较高的单克隆抗体。而在中间部分,由于样品基质(盐、缓冲化合物和洗涤剂)造成的强干扰,如离子抑制和多种加合离子的形成,并未观察到抗体信号(1c)。流束的尾部也显示出清晰的质谱信号(1d),因此推断前后区域的纯度水平接近。此外,在此次TADA-MS测量中观察到的单体(26+~31+)和二聚体(37+~45+)的带电状态与HeckVan Den Heuvel基于蛋白质的折叠状态和带电残基机制计算的理论带电状态(单体为29.9+,二聚体为42.3+)非常一致,说明分析的整个过程都保持了抗体的原始构象。对ramucirumabTADA-MS分析使得在原生条件下,无需任何的预处理,就能确定完整单克隆抗体(mAbs)的分子质量,并且还能够清晰地观察到糖基化模式。去卷积谱中的主要峰值分别出现在146595.0146754.4146916.7147078.7 Da,分别对应于G0F/G1FG1F/G1FG0F/G2FG2F/G1FG2F/G2F糖型。

1天然TADA-MS测定Cyramza (10 mg/mL雷莫芦单抗)
此外,作者还展示了TADA-MS技术在分析其他不同类型蛋白质和蛋白质复合物时的应用。在分析血红蛋白复合物时,TADA-MS技术同样表现出了其在非变性条件下分析蛋白质的能力,能够检测到与血红素结合的蛋白质复合物holo-Hb, αH2c)以及蛋白质的寡聚体形式2β2, αβ (2d)。此外,对比了Concanavalin A在变性直接注入和TADA-MS分析获得的MS1谱图,如3a-b所示,变性条件下(1 M FA)可观察到单体、二聚体和水解的蛋白亚基片段(蛋白质成熟过程中形成),而在天然条件下则能观察到额外的四聚体信号,这因为四聚体的形成需要两个去质子化的组氨酸残基(pH值应高于6)Con A与碳水化合物结合依赖于Ca2+Mn2+离子,这些离子稳定了蛋白质的结构。由于二聚体和四聚体的宽峰(由加合物形成引起)和单体获得的低强度,与蛋白质相结合的金属离子的存在不能在MS1谱图中得到证明(3a-b)。通过在源内裂解低聚物的方式,观察到了单体Con A及其两种水解产物,产生了更多的电荷态和更高的信号强度,从而能够鉴定与该蛋白相关的Ca2+-Mg2+Ca2+-Mn2+离子(3d)。这些结果表明,TADA-MS技术在非变性质谱分析中具有显著优势,能够提供关于蛋白质或蛋白质复合物的详细信息,包括分子质量、糖基化模式以及蛋白质复合物的组装状态,而无需复杂的样品预处理步骤。

2 天然TADA-MS测定血红蛋白

3 比较变性直接进样和天然TADA-MS分析Concanavalin A

总之,TADA-MS分析具有以下优势:1)灵敏度提升:TADA-MS能够显著降低基质干扰,灵敏度提高超过25倍。2)天然环境:该方法允许在接近生理条件下进行分析,使用PBS等缓冲液保持蛋白质的天然状态。3)流程简单:无需进行预处理或缓冲液交换,节省了时间和成本。TADA-MS为天然蛋白质的分析提供了一种高效、灵敏且简化的解决方案。该技术的应用前景广阔,尤其是在制药行业中,能够加速生物制剂的开发和质量控制。未来的研究可以进一步探索TADA-MS在其他生物分子分析中的潜力。





撰稿:刘蕊洁

编辑:李惠琳

原文:Taylor−Aris Dispersion-Assisted Mass Spectrometry for the Analysis of Native Proteins



李惠琳课题组网址
www.x-mol.com/groups/li_huilin




参考文献

1. Szabo R, Gyemant G, Nagy C, Andrasi M, Gaspar A. Taylor-Aris Dispersion-Assisted Mass Spectrometry for the Analysis of Native Proteins. Anal Chem. 2024; 96(28): 11309-11317. doi:10.1021/acs.analchem.4c01270


李惠琳课题组
推介Top-down MS原理、新技术、新方法以及相关结构质谱方法及其在翻译后修饰调控机制、蛋白-药物相互作用、 蛋白质机器结构及功能解析等领域的前沿文献与工作交流。
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