2024.10.12 活动预告 | 影像组学中的器官分割与肿瘤检测

文摘   2024-10-10 20:45   中国  

主讲人:刘洁 香港城市大学博士生,主要研究方向为医疗图像人工智能

主持人:沈奕祺 浙江大学生仪学院博士生,主要研究方向为影像转录组

活动大纲

1. 影像组学简介:影像组学在医疗诊断和治疗中的作用:

  • 影像组学包含的模态:包括CT、MRI、PET、超声等不同模态的概览及其作用
  • 传统医疗影像分析和影像组学的区别:主要依赖于放射科医生的视觉检查和主观判断vs采用高通量计算方法,从图像中提取大量定量特征;主要依赖经验和定性分析vs使用先进的统计学和机器学习方法进行定量分析;存在观察者间的差异vs使用标准化的算法,提高了结果的客观性和可重复性;依赖于专家阅片,耗时较长vs可以快速处理大量数据。
  • 影像组学在医疗诊断和治疗中的作用: 早期检查:利用高级算法分析影像特征,可以识别早期、微小的病变;鉴别诊断:通过分析复杂的影像特征模式,帮助区分相似的疾病;自动化筛查:用于大规模人群筛查,提高效率和准确性;复发风险评估:评估疾病复发的风险,指导随访计划;放疗计划:优化放射治疗的靶区定位和剂量分布等等。
基于深度学习的X-ray 处理例子

2. 器官分割和肿瘤检测概览

  • 传统方法简介:包括阈值法,区域生长法
  • 深度学习方法概览:
    2D模型:CNN,Unet,Vnet
    3D模型:3D Unet,SwinUNETR
  • 前沿方法介绍:
    大规模视觉模型: 基于大规模数据和语言模型的CT影像诊断和分割
    多模态大语言模型:基于多模态大语言模型的影像组学处理
  • 肿瘤检测的有趣案例: Large-scale pancreatic cancer detection via non-contrast CT and deep learning,基于大规模non-contrast CT训练深度学习网络。从2万病例中识别出31例漏诊

3. 实操分析

  • Python的MONAI工具包介绍
  • 影像预处理:数据加载,空间标准化处理,强度裁剪和放缩,数据增强
  • 网络、损失函数
  • 训练
  • 模型微调

参考文献

[1] Liu, Jie, et al. "Clip-driven universal model for organ segmentation and tumor detection." Proceedings of the IEEE/CVF International Conference on Computer Vision. 2023.
[2] Liu, Jie, et al. " Enhancing 3D Medical Multi-Modal Lagre Language Models with Integrated Human Body Priors." In submission.
[3] Bai, Fan, et al. "M3d: Advancing 3d medical image analysis with multi-modal large language models." arXiv preprint arXiv:2404.00578 (2024).
[4] Cao, Kai, et al. "Large-scale pancreatic cancer detection via non-contrast CT and deep learning." Nature medicine 29.12 (2023): 3033-3043.

影像组学中的器官分割与肿瘤检测

  • 主讲人:刘洁,香港城市大学博士生,主要研究方向为医疗图像人工智能
  • 时间:2024年10月12日(周六)10:00-12:00
  • 地点:线上腾讯会议

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编辑 | 刘洁

排版 | 张皓凯


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