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主讲人:胡磊 ,西湖大学生命科学学院2023级博士,主要研究方向为AI for Life Sciences,个人主页为dbinary.github.io
主持人: 余东林,北京大学医学部博士生,主要研究方向为肿瘤转移的单细胞转录组分析
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活动简介
在一年前的BioLinkX特别活动上,我们为大家系统介绍了OmicVerse,一个集成了多种转录组学分析算法的分析框架。这一年来,我们不断努力,为OmicVerse添加了一系列新分析的功能,拓展了对scRNA-seq和空间转录组学数据分析的支持,而OmicVerse也于今年7月在Nature Communications杂志上发表。(详细内容请浏览下方公众号推文)
BioLinkX成果速递 | Nature Communications:转录组学分析全生态算法框架OmicVerse
我们这篇Nature Communication背后的故事( 第一作者解读)
主要内容
在本次生信半月谈中,我将详细介绍OmicVerse在过去一年中新增的功能,这些功能不仅涵盖了转录组学和空间组学的分析工具,还包括了用于数据可视化的先进绘图函数。我还将分享OmicVerse未来的发展方向,以及我们计划封装的新分析算法。此外,我将以自己马上preprint的一篇工作为例,介绍OmicVerse如何助力单细胞组学分析。OmicVerse的教程可以从以下链接中获得:https://starlitnightly.github.io/omicverse/
此外,OmicVerse配套了相关的单细胞转录组分析中文教程:
https://single-cell-tutorial.readthedocs.io/zh/latest/
基于Python的转录组学数据分析框架OmicVerse的新功能与进展
主讲人: 胡磊 ,西湖大学生命科学学院2023级博士,主要研究方向为AI for Life Sciences 时间: 2024年9月15日(周日)14:00-16:00 地点: 线上腾讯会议941-1804-7373 & 微信视频号直播 & 线下浙江大学紫金港校区医学综合楼 205会议室
学术部纳新&知识分享官投稿征集!
自 2023 年 1 月 1 日起 BioLinkX 学术部面向全社会所有生物信息学研究者全年开放招募。详情点击查看原文:BioLinkX | 学术部纳新持续进行中!
BioLinkX「知识分享官」是「生信半月谈」 的延伸和补充。详情点击查看原文:BioLinkX「知识分享官」投稿征集中!
本期活动直播向全社会线上线下免费开放(非浙大师生需通过预约进入校园),活动资料(录播/ppt/代码demo等)对协会成员免费开放,非协会成员可付费获得资料权限,该收入将用于激励主讲人以及协会发展。本次活动定价 50 元,添加小助手微信(请备注BioLinkX)转账即可。
欢迎志同道合的朋友们加入 BioLinkX 生物信息学交流群 ~ 由于目前群已满 200 人,同时避免部分商家频繁加群打广告影响群友正常交流,请加小助手微信并支付15元(购买门票可免费入群),拉您入群(请备注BioLinkX),群运营所得将用于群内活动支出。
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编辑 | 胡磊
排版 | 张皓凯