2024.6.16 活动预告 | 高通量测序在解析骨干亲本优势性状遗传基础中的应用

文摘   2024-06-13 16:17   山东  

主讲人:何光琪,浙江大学生命科学学院博士生,研究方向为植物功能基因组学,擅长利用生物信息学手段挖掘控制作物重要性状的关键基因。
主持人:林诗琪,浙江大学农业与生物技术学院博士生,主要研究作物遗传育种。

活动大纲

  • 骨干亲本及其育种价值
    • 骨干亲本的定义
    • 骨干亲本的特征
    • 骨干亲本的应用
  • 骨干亲本研究方法的发展
    • 简单串联重复(SSR)等分子标记
    • 单核苷酸多态性(SNP)芯片
    • 高通量测序(二代、三代测序)
  • 利用高通量测序研究骨干亲本的案例
    • 葡萄骨干亲本果实成熟期的遗传基础解析
    • 分析、研究过程中的注意事项
  • 泛基因组在骨干亲本研究中的应用前景
    • 泛基因组的定义
    • 泛基因组的构建方式
    • 泛基因组在解析性状遗传基础上的优势

背景介绍

2003年,庄巧生院士提出“骨干亲本”的概念,即:在杂交育种过程中起着骨干作用,用其培育出数目较多的大面积推广品种,或由其衍生出许多具有广泛应用价值的亲本育种材料。

骨干亲本是新品种培育的重要种质类型,是实现品种升级换代的关键。在我国小麦、玉米、水稻、棉花等主要栽培作物的育种历程中,骨干亲本都发挥着重要的品种改良和生产实践作用,培育出了一系列抗病、高产、矮杆的主栽品种,形成我国特有的品种群[1]。例如携带“绿色革命”相关基因 sd1(半矮秆基因)水稻地方品种“矮仔占”,是我国 20 世纪 60-80 年代水稻矮化育种的重要基因源,利用其培育品种至少370个[2]玉米地方品种“四平头”的骨干亲本自交系“黄早四”,开创了我国紧凑型玉米育种新局面,“黄早四”及其衍生材料已经成为我国黄淮海夏播玉米区不可或缺的种质类型之一[3]。此外,常见的骨干亲本还有玉米(掖 478、P78599、吉853、Mo17、郑58、B73)、水稻(矮仔占、低角乌尖、矮脚南特、农垦58、旭、IR26)、小麦(蚰子麦、矮孟牛、燕大1817、南大 2419、北京8号)等。

挖掘和鉴定控制作物性状的关键遗传位点,以及从基因组学层面系统地解析骨干亲本这些优良性状的遗传基础,是当前科学领域的前沿问题。这些研究为未来育种亲本的选配、骨干亲本的改良和新品种的创制提供重要的理论基础和科学依据。

图1. 一个高产水稻骨干亲本在系谱中高产性状传递的示意图

参考文献

[1] 李永祥, 王天宇, 黎裕. 主要农作物骨干亲本形成与研究利用[J]. 植物遗传资源学报, 2019 (5): 1093-1102.

[2] 汤圣祥,王秀东,刘旭.中国常规水稻品种的更替趋势和核心骨干亲本研究. 中国农业科学,2012,45(8):1455-1464.

[3] 黎裕,王天宇.我国玉米育种种质基础与骨干亲本的形成. 玉米科学,2010,18(5):1-8.

高通量测序在解析骨干亲本优势性状遗传基础中的应用

  • 主讲人:何光琪,浙江大学生命科学学院博士生,研究方向为植物功能基因组学,擅长利用生物信息学手段挖掘控制作物重要性状的关键基因。
  • 时间:2024年6月16日(周日)14:00-16:00
  • 地点:线上腾讯会议+线下紫金港校区


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编辑 | 何光琪

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