为响应浙江大学第二十六届学生社团文化节“展示浙江大学百家争鸣、百花齐放的社团风貌，促进学生社团的品牌、文化建设，推动校园文化蓬勃健康发展”精神，BioLinkX将参加社团文化节开幕式游园会活动，时间、地点、游园会游戏规则简述如下——
时间：2024.10.19 10:00-17:00 地点：浙江大学紫金港校区文化广场B区I摊位（见下图）
游戏1：蛋白质序列配对大师
游戏背景：
动态规划算法是生信的经典算法之一，可用于蛋白质序列配对。游戏规则：
玩家根据给定的计分规则（已知的氨基酸配对表），应用动态规划算法（动态规划规则详见游戏示例），手动计算出两条蛋白质序列的最高配对值，根据完成时间分档领取社团周边奖励。
游戏示例：
初始将给出两条蛋白质氨基酸序列，以序列1“ADEF”，序列2“ADFG”为例。
Step1 将两序列分别填入横纵两列，由第一格的（A，A）在配对表中查得分值为5，作为起始分值。
Step2 每格有三种动态规划方式（向下、向右、斜向右下），此处补充介绍动态规划规则。
向下、向右：遵循空位罚分机制（配对表右上注明罚分为-4，基础分为所在格子分数），如（A,A）5分向右或向下均为罚分-4分，得到1分；
斜向右下：查配对表得到改变分值，如（A,A）5分斜向右下到（D,D）+6分，则累积为11分。
Step3 比较三种动态规划方式获得的最终分值，取最高配对值填入作为本格分值，例如到（D,D）格的三种方式分值分别为11分（5分向右下）＞-3分（1分向下）＝-3分（1分向右），因此选择分数最高的11填入（D,D）格。
Step4 以此类推得到最终最高配对值。
游戏2：进化树游戏
游戏背景：
最大简约法（Maximum Parsimony）是一种常使用于系统发生学分析的方法。它基于生物演化应遵循简约性原则的假设，即所需变异次数最少（演化步数最少）的演化树可能为最符合自然情况的系统树。
该方法通过比较物种之间的离散型性状（包括形态学性状和分子序列如DNA、蛋白质等）的变异程度，来构建生物的系统发育树，并分析生物物种之间的演化关系。游戏规则：
玩家将拿到一组印着不同物种的卡片，请根据不同性状来为它们选择或绘制合适的进化树，使得进化树所有分支上加起来的变异次数总和最小。游戏示例：
例如，以下有一组核苷酸序列：AAGC,AAGA,UCGA,ACGC 在绘制方式相同但氨基酸位置不同的进化树中：
如图1所示，前后共需要经历5次变异（UCGA→AAGC需3次，AAGC→AAGA需1次，AAGC→ACGC需1次）；
如图2所示，共需要经历4次变异（AAGA→AAGC需1次，AAGC→ACGC需1次，ACGC→UCGA需2次），相较图1次数更少，更加“简约”，才是我们需要的答案。
2024.10.19 10:00-17:00，我们在文广期待你的到来！（有社团周边作为游戏礼品赠送！）
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