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主讲人：莫传鑫，西南科技大学生命学院研究生，主要研究方向为生物质资源学
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主持人：彭若轩，河北农业大学研究生，主要研究方向为棉花基因组学
活动大纲
引言
背景、T2T（端粒到端粒）基因组的重要性
基因组Survey
基因组大小、杂合度及重复序列评估
基因组组装
测序及数据处理、组装策略与工具选择、组装质量初步评价、Hic数据处理、挂载工具与案例分享、补洞、端粒延长思路与工具 T2T组装结果评价：N50、连续性、碱基质量值、完整性与覆盖度等
基因组注释
注释策略与工具、编码基因结构注释、重复序列与转座子注释、rRNA, tRNA, miRNA等的注释、编码基因功能注释
T2T组装与分析建议 T2T组装挑战与未来
主要内容
本报告重点介绍T2T（端粒到端粒）基因组组装的一般流程。首先对目标基因组的大小、杂合度及重复序列特性进行评估，判断基因组项目的可行性和成本。然后进行基因组测序与组装。通过N50值、完整性等指标对组装质量进行初步评价。运用Hic测序技术进行基因组染色体挂载，随后进行基补洞与端粒延长，得到近似完整的T2T基因组，并进行全基因组质量评价（N50、连续性、碱基质量值、完整性与测序数据覆盖度）。进一步完成基因组注释工作，涵盖编码基因结构与功能、重复序列、转座子及非编码RNA的注释。最后，讨论T2T组装过程中的挑战与未来发展方向，并提出进一步优化的建议。
基因组终章：T2T基因组组装及注释
主讲人：莫传鑫，西南科技大学生命学院研究生，主要研究方向为生物质资源学 时间：2024年8月31日(周六) 14:00-16:00 地点：线上腾讯会议
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编辑 | 莫传鑫
排版 | 张皓凯
