今日开讲 | 分子模拟系列公开课,第1讲带你探索分子模拟概论!

学术   2024-11-11 18:03   山东  
11月系列公开课

分子模拟概论

分子模拟在材料体系中的应用概述-第一讲



分子模拟(Molecular Simulation) 利用计算机以原子水平的分子模型来模拟分子结构与行为,进而模拟分子体系的各种物理、化学性质的方法。它是在实验基础上,通过基本原理,构筑起一套模型和算法,从而在原子-分子层次上研究基础化学中的重要原理、物质的化学性质、化学反应等。主要培养实验者从微观角度描述和解释实验现象,多尺度展示自己的工作成果。

特邀山东大学理论研究所徐教授为我们深入解析分子模拟在材料体系中的应用概述系列课程第一讲之分子模拟概论。本次系列讲座将聚焦于包括电解质材料体系;MOF、COF等多孔材料体系;相界面材料体系等)基于分子模拟计算实例设计,为初学者提供一个从分子层面理解化学物质结构与性能关系的平台。诚邀对材料科学和分子模拟感兴趣的老师和同学们参与此次学术盛宴,共同探索分子模拟的奥秘与魅力。期待您的参与!




一、讲师介绍


徐教授

·山东大学理论研究所

·齐鲁工业大学教授

·在JMCA、JEC、AMI等期刊发表SCI论文90余篇。

2011年博士毕业于山东大学理论研究所,同年进入齐鲁工业大学工作。于2014-2016年赴佐治亚理工学院从事博后工作,师从Jean-Luc Bredas 教授。近年来,科研方面主要采用分子模拟方法研究多尺度复杂体系的聚集结构,采用第一性原理进行锂电池材料计算等,擅长根据实验者的研究内容设计能从围观角度给予支撑的理论计算。精通Gromacs,amber,Materials studio,Gaussian等计算软件。主持省国家自然基金1项,自部级基金5项。



CONSERVANCY
二、课程目录



时间
11月11日(周一)19:00-20:30




1
力场



01

什么是势函数,具体形式有哪些;常见力场介绍,如OPLS、CHARMM、AMBER、COMPASS等
02

特殊力场形式,如联合原子、马提尼粗粒力场等
03

如何正确选择立场


2
能量最小化
(
01

势能面和极小值的概念
02

能量最小化的方法选择
03

收敛性判据
3
模拟中的基本原理


01

短程相互作用,如什么是周期性边界条件,最近镜像法等
02

长程相互作用,如Ewald求和法、PPPM方法等
03

如何完成一个完整的模拟过程:初始构型的建立-》平衡的判断-》轨迹的常规分析-》偏差分析


4

模拟中的基本原理


5
常见错误与误区



01

部分课程内容如下


CONSERVANCY
三、参与方式



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