生物分子层析技术合集:20篇精选文章汇聚中国等12个国家中20所知名高校与研究所的成果

学术   科学   2024-07-05 07:30   北京  


导言

层析技术是一种用于分离和纯化混合物中不同成分的关键方法,它在科学研究和生物医药领域中扮演着核心角色。

为了推广这一重要技术,Bio-protocolCytiva 合作推出了《生物分子层析实验方法》电子合集。这本合集的内容从基础知识延伸到高阶应用,涵盖了蛋白质结构学、免疫学、神经科学等多个前沿领域,并汇总了来自顶级学术期刊的“独门秘籍”。我们期望这本合集能够成为促进层析技术学术研究和实践应用的重要资源。

在上一期内容中,我们讨论了“如何选择合适的层析技术,以实现最佳的纯化效果”。本期小Bio将继续为大家介绍这本手册,本文展示了手册中层析技术的文章,更多文章请到 bio-protocol.org 免费阅览及下载。电子合集的下载途径请见文末。



《生物分子层析实验方法》电子合集封面

20篇文章汇总








文章单位索引:

1.澳大利亚伯内特医学研究院
2.意大利维也纳大学
3.美国加利福尼亚大学旧金山分校
4.美国斯坦福大学医学院
5.瑞士苏黎世大学
6.德国杜塞尔多夫大学
7.美国美利坚大学
8.法国巴黎大学
9.美国托马斯杰斐逊大学
10.乌拉圭共和国大学理学院
11.中国天津大学
12.美国威尔康奈尔医学院
13.加拿大蒙特利尔临床研究所
14.美国约翰霍普金斯大学
15.美国埃默里大学
16.印度科学教育与研究学院
17.日本横滨理化学研究所
18.爱尔兰利莫瑞克大学
19.英国罗莎琳德富兰克林研究所
20.中国台湾“中央研究院”生物化学研究所

● Co-sedimentation Assay for the Detection of Direct Binding to F-actin

通过共沉淀实验检测 F-Actin 的直接结合蛋白

链接:https://doi.org/10.21769/BioProtoc.270

作者:Wilson Wong、Jian-Guo Zhang、Jake Baum、Mireille H. Lahoud、Ken Shortman

● Determination of Hydrodynamic Radius of Proteins by Size Exclusion Chromatography

用尺寸排阻层析法测定蛋白质的流体动力学半径

链接:https://doi.org/10.21769/BioProtoc.2230

作者:Valentina La Verde、Paola Dominici、Alessandra Astegno

● Protein Expression and Purification of the Hsp90-Cdc37-Cdk4 Kinase Complex from Saccharomyces cerevisiae

Hsp90-Cdc37-Cdk4 激酶复合物在酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)中的表达和纯化

链接:https://doi.org/10.21769/BioProtoc.2563

作者:Kliment A. Verba、David A. Agard

● Guanine Nucleotide Exchange Assay Using Fluorescent MANT-GDP

用荧光 MANT-GDP 进行鸟嘌呤核苷酸交换实验

链接:https://doi.org/10.21769/BioProtoc.2795

作者:Tomoharu Kanie、Peter K. Jackson

● Heterologous Expression and Purification of the CRISPR-Cas12a/Cpf1 Protein

CRISPR-Cas12a/Cpf1 的异源表达和纯化

链接:https://doi.org/10.21769/BioProtoc.2842

作者:Prarthana Mohanraju、John van der Oost、Martin Jinek、Daan C. Swarts

● α-Synuclein Aggregation Monitored by Thioflavin T Fluorescence Assay

通过硫黄素T荧光检测法监测 α-突触核蛋白聚集

链接:https://doi.org/10.21769/BioProtoc.2941

作者:Michael M. Wördehoff、Wolfgang Hoyer

● Preparation of a Bacteriophage T4-based Prokaryotic-eukaryotic Hybrid Viral Vector for Delivery of Large Cargos of Genes and Proteins into Human Cells

制备可将大量基因和蛋白质送入人类细胞的基于噬菌体 T4 的原核-真核杂合病毒载体

链接:https://doi.org/10.21769/BioProtoc.3573

作者:Jingen Zhu、Pan Tao、Marthandan Mahalingam、Venigalla B. Rao

● Preparation of Yeast tRNA Sample for NMR Spectroscopy

制备酵母tRNA 样本用于核磁共振波谱分析

链接:https://doi.org/10.21769/BioProtoc.3646

作者:Marjorie Catala、Alexandre Gato、Carine Tisné、Pierre Barraud

● Karyopherin-β2 Inhibits and Reverses Aggregation and Liquid-liquid Phase Separation of the ALS/FTD-Associated Protein FUS

核转运蛋白(Karyopherin)-β2抑制并逆转 ALS/FTD 相关蛋白FUS 的聚集和液-液相分离

链接:https://doi.org/10.21769/BioProtoc.3725

作者:Emma Robinson、James Shorter、Lin Guo

● RI-SEC-seq: Comprehensive Profiling of Nonvesicular Extracellular RNAs with Different Stabilities

RI-SEC-seq:对不同稳定性的非囊泡胞外 RNA 的综合分析法

链接:https://doi.org/10.21769/BioProtoc.3918

作者:Juan Pablo Tosar、Fabiana Gámbaro、Mauricio Castellano、Alfonso Cayota

● Expression and Purification of the Human Cation-chloride Cotransporter KCC1 from HEK293F Cells for Structural Studies

用于结构研究的人类阳离子-氯化物共转运体KCC1 在HEK293F 细胞中的表达和纯化

链接:https://doi.org/10.21769/BioProtoc.3966

作者:Si Liu、Jiangtao Guo

● FRET-based Microscopy Assay to Measure Activity of Membrane Amino Acid Transporters with Single-transporter Resolution

基于 FRET 的显微镜检测法,以单体转运蛋白的分辨率测定膜氨基酸转运体的活性

链接:https://doi.org/10.21769/BioProtoc.3970

作者:Didar Ciftci、Gerard H. M. Huysmans、Xiaoyu Wang、Changhao He、Daniel Terry、Zhou Zhou、Gabriel Fitzgerald、Scott C. Blanchard、Olga Boudker

● Identification of R-loop-forming Sequences in Drosophila melanogaster Embryos and Tissue Culture Cells Using DRIP-seq

通过 DRIP 测序鉴定黑腹果蝇胚胎和组织培养细胞中的 R环形成序列

链接:https://doi.org/10.21769/BioProtoc.4011

作者:Célia Alecki、Nicole J. Francis

● Synchronized Real-time Measurement of Sec-mediated Protein Translocation

同步实时测量由 Sec 介导的蛋白质转位

链接:https://doi.org/10.21769/BioProtoc.4129

作者:Riti Gupta、Dmitri Toptygin、Christian M. Kaiser

● Measurement of the Translational Diffusion Coefficient and Hydrodynamic Radius of Proteins by Dynamic Light Scattering

通过动态光散射法测量蛋白质的平移扩散系数和流体动力学半径

链接:https://doi.org/10.21769/BioProtoc.4195

作者:Ernest T. Parker、Pete Lollar

● Heterologous Expression and High Degree Purification of the Restriction Endonuclease SauUSI

限制性内切酶 SauUSI 的异源表达和高度纯化

链接:https://doi.org/10.21769/BioProtoc.4275

作者:Vinayak Sadasivam Tumuluri、Kayarat Saikrishnan

● Apoplastic Expression of CARD1-ecto Domain in Nicotiana benthamiana and Purification from the Apoplastic Fluids

在本氏烟草(Nicotiana benthamiana) 质外体中表达及提纯 CARD1 胞外结构域的方法

链接:https://doi.org/10.21769/BioProtoc.4387

作者:Nobuaki Ishihama、Anuphon Laohavisit、Kaori Takizawa、Ken Shirasu

● Expression, Purification, and in vitro Enzyme Activity Assay of a Recombinant Aldehyde Dehydrogenase from Thermus thermophilus, using an Escherichia coli host

以大肠杆菌为宿主细胞的嗜热栖热菌重组醛脱氢酶的表达、纯化和体外酶活性测定

链接:https://doi.org/10.21769/BioProtoc.4401

作者:Kim Shortall、Edmond Magner、Tewfik Soulimane

● Production and Crystallization of Nanobodies in Complex with the Receptor Binding Domain of the SARS-CoV-2 Spike Protein

SARS-CoV-2 刺突蛋白受体结合域与纳米抗体形成复合物的生成和结晶

链接:https://doi.org/10.21769/BioProtoc.4406

作者:Audrey Le Bas、Halina Mikolajek、Jiandong Huo、Chelsea Norman、Joshua Dormon、James H. Naismith、Raymond J. Owens

● Preparation of Cas9 Ribonucleoproteins for Genome Editing

制备用于基因组编辑的 Cas9 核糖核蛋白

链接:https://doi.org/10.21769/BioProtoc.4420

作者:Sheng-Wei Lin、Viet Quoc Nguyen、Steven Lin

电子合集下载途径











如果您想要深入了解层析技术的种类选择和具体流程,请扫描下方二维码点击“阅读原文”免费下载查阅这本电子合集。该合集还涵盖了生物分子纯化策略主流层析系统(ÄKTA的详细介绍、汇集了Bio-protocol 期刊发布的层析实验方案中文版。我们期望这本合集能够成为您实验桌上的一本宝贵电子工具书,助力您的科研工作。


关于Bio-protocol








Bio-protocol (bio-protocol.org)于2011年在斯坦福大学创建,旨在提高科研的可重复性,以助力科学发现。它与 eLifeScience/AAAS等国际知名学术机构合作,致力于提升科研方案的透明度和共享。Bio-protocol期刊是 Bio-protocol 旗下一份同行评审的国际学术期刊,专注于发表高质量的生命科学实验方案。至今,已发表来自全球两万多名科研工作者的近5000 篇文章。该期刊已被PubMed Central、Web of Science 、Scopus以及DOAJ等数据库收录,是全球为数不多的拥有影响因子的生物学实验方案期刊之一。Bio-101 是Bio-protocol旗下一个中文生命科学实验方案的共享平台,通过与上百个国内一流科研单位的合作,已出版了多本高质量、开放获取的中文实验方案电子手册,促进中国科研人员之间的交流和合作

关于Cytiva








Cytiva(思拓凡)是全球生命科学领域的先行者,在全球40余个国家和地区拥有约16000名员工,致力于推动未见技术,加速非凡疗法。作为值得信赖的合作伙伴,Cytiva积极携手学术及转化医学领域的研究人员、生物技术开发者和制造商,专注于生物药物、细胞和基因疗法以及mRNA为代表的一系列创新技术的研究,通过提升药物研发和生物工艺的能力、速度、效率和灵活性,为惠及全球患者开发和生产变革性药物和疗法。


END



BioscienceProtocols
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