自动化与高通量筛选结合:提高感染病毒的检测效率与准确性

学术   科学   2024-11-05 07:30   北京  

本文通过ChatGLM/GPT进行辅助对近期Bio-protocol 期刊发表的方案进行解读和概括,若感兴趣请点击“阅读原文”查看详细的实验流程及试材。如果解读中有任何错误或遗漏,敬请指正

2024年10月20日,Bio-protocol 期刊在线发表了新加坡杜克大学-新加坡国立大学医学院(Duke–National University of Singapore Medical School)Kitti Wing Ki Chan团队题为“An Improved Focus-Forming Assay for Determination of the Dengue Virus Titer”的方法文章。

https://doi.org/10.21769/BioProtoc.5084
关键词登革病毒临床分离株 斑块法 聚焦形成法 BHK-21细胞 Vero细胞 自动成像 自动焦点计数 抗病毒化合物筛选

斑块法(Plaque assay)一种用于定量病毒感染力的实验技术。这种方法通过测量在特定细胞层上形成的病毒斑块来评估病毒的感染力和浓度。斑块形成是因为病毒感染并最终杀死培养板上的细胞,从而在细胞单层上形成清晰可见的圆形或椭圆形透明区。这些透明区称为“斑块”,每个斑块代表一个初始病毒粒子

登革热是由登革病毒(DENV)引起的一种常见且流行的蚊媒传染病,全球超过40%的人口处于感染风险之中。每年约有4亿人感染该病毒,其中1亿人表现出临床症状,包括登革出血热,年死亡人数约为2.5万。DENV有四种抗原性不同的血清型(DENV-1至DENV-4),它们在结构和非结构蛋白上的差异对疾病的诊断和治疗具有重要意义。鉴于登革热的全球影响,开发出一种准确、高效的病毒定量测定方法对于抗病毒药物的研发至关重要。目前,斑点形成测定(FFA)和斑点测定被广泛认为是病毒量测定的金标准,然而,传统的FFA方法在一些步骤上存在局限,特别是在检测某些DENV血清型时的敏感性和特异性方面还有待提高。因此,研究人员持续探索优化这些技术,以期提高测定的准确性和应用范围,特别是在高通量药物筛选中的应用


  • 使用BHK-21细胞对所有DENV-1至DENV-4血清型的斑点和焦点进行检测,相比使用Vero细胞展示出更高的灵敏度。

  • 通过使用广谱黄病毒E蛋白抗体,并定义每个焦点至少包含8个感染细胞,有效减少假阳性结果。

  • 利用Operetta®高内容成像系统,自动化数字捕捉感染细胞的图像,提高了实验的效率和重复性。

  • 高通量药物筛选
    改进的FFA方法适用于高通量筛选(HTS),可以用于大规模筛选抗病毒化合物,加速抗病毒药物的发现和开发。
  • 病毒检测与量化
    ‍该方法可以用于更准确地检测和量化不同血清型的登革病毒,尤其是那些在传统Vero细胞中难以形成明显斑点的DENV-4。
  • 抗体测试
    使用广谱黄病毒E蛋白抗体进行病毒检测,可以评估抗体的中和效果,对疫苗研发和抗体疗法的评估具有重要意义。


这个方法的可重复性已经被本文作新加坡杜克大学-新加坡国立大学医学院(Duke–National University of Singapore Medical School)Kitti Wing Ki Chan团队验证过,相关实验数据与结果请见原文的“Validation of protocol”章节

温馨提示:积极引用本文不仅是对作者创新技术和科研共享的最佳肯定,也是确保实验可复现性的重要方式。

Mahid, M. B. A., Bist, P., Sigmundsson, K., Mazlan, M. D. B. M., Watanabe, S., Choy, M. M., Vasudevan, S. G. and Chan, K. W. K. (2024). An Improved Focus-Forming Assay for Determination of the Dengue Virus Titer. Bio-protocol 14(20): e5084. DOI: 10.21769/BioProtoc.5084.

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