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文献图片展示：
1、加载R包（未安装需要自行安装）：
library(ggplot2) # Create Elegant Data Visualisations Using the Grammar of Graphics
library(dplyr) # A Grammar of Data Manipulation
library(rstatix) # Pipe-Friendly Framework for Basic Statistical Tests
library(ggsignif) # Significance Brackets for 'ggplot2' 2、加载数据（随机编写，无实际意义，这里只是为了展示绘图方法而编写的数据，和文章原始数据是不一样的）并根据绘图需求处理数据：
df <- read.table("data.txt",sep="\t",header = T, check.names = F)
df2 <- read.table("data2.txt",sep="\t",header = T, check.names = F)
##为了将气泡图正确添加到指定箱线图上方，需要对各图最大值最小值进行统计
data_position <- df %>%
group_by(`Positive/Negative`,Group, Period) %>%
summarise(MaxValue = max(Correlation),
MinValue = min(Correlation))
#将数据添加进df2
df3 <- merge(df2, data_position, by = c("Positive/Negative","Group", "Period"))
###根据分组计算各Period中GroupA与GroupB间的差异性
data_sig <- df %>%
group_by(`Positive/Negative`, Period) %>%
t_test(Correlation ~ Group) %>%
add_significance("p") %>%
add_xy_position(x = "group")
## 为了实现文献图中的x轴效果，这里构造标签数据
df_label <- data.frame(
Period = unique(df$Period)
)
df_label <- merge(df_label, df3[1:6,2:4],by="Period")3、绘图模板展示（模板部分注释源码及原始测试数据可在公众号后台查看具体获取方式）：
最后在AI中进行细节调整可得到如下效果图：
需要附带注释的源码及测试数据请查看下方绘图模板获取方式！！
PS: 以上内容是小编个人学习代码笔记分享，仅供参考学习，欢迎大家一起交流学习。
「R绘图模板」跟着New Phytologist学绘图—共发生网络图的绘制！！！！！！
「R绘图模板」气泡图+非等宽分面+分组！！！
「R绘图模板」箱线图+散点+均值连线+显著性的箱上箱下标注！！！
「R绘图模板」环形多组火山图+标签！！！
「R绘图模板」组合图系列—相对丰度柱状堆积图+单组柱状图+显著性！！！
「R绘图模板」气泡图+分组+标签+拟合曲线！！！
「R绘图模板」多变量热图+r值+p值+其他变量！！！
「R绘图模板」用于两组比较的多图形并列组合图-小提琴图+箱线图+散点图！！！
「R绘图模板」跟着Science学绘图—世界地图+采样点标记气泡图+分布频率注释侧图！！！
「R绘图模板」基因注释+箭头图+分面+标签！！！
「R绘图模板」组合图系列-箱线图+散点+分组散点注释！！！
「R绘图模板」世界地图+采样点标记+柱状堆积图！！！
「R绘图模板」环形无分组排序柱状堆积图！！！
「R绘图模板」多y轴组合图-柱状堆积图+箱线图！！！
「R绘图模板」环形分组气泡图（重发版-修改标题）！！！
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「R绘图模板」进化树+分组注释+配对连线！！！
「R绘图模板」组合图-并列柱状图+数字标签+误差棒+占比饼图！！！
「R绘图模板」箱线图+显著性差异着色+分组差异检验！！！
「R绘图模板」柱状堆积图+柱间连线+文本标签+误差棒+字母标记！！！
「R绘图模板」环形分组散点图+误差棒+分组标签+灰白间隔背景+辅助线！！！
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「R绘图模板」组合图-进化树+柱状图+箱线图+热图！！！
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「R绘图模板」世界地图+采样点标记+分组条形图+柱状图嵌套！！！
「R绘图模板」多分组箱线图+不同组字母标记+条纹填充！！！
「R绘图模板」并列柱状图+不同组字母标记+组间显著性标记！！！
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R可视化——一文带你打通ggplot2个性化绘制箱线图（更新版）！！！
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