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文献图片展示：
1、加载R包（未安装需要自行安装）：
library(ggplot2) # Create Elegant Data Visualisations Using the Grammar of Graphics
library(dplyr) # A Grammar of Data Manipulation
library(ggfittext) # Fit Text Inside a Box in 'ggplot2'
library(ggrepel) # Automatically Position Non-Overlapping Text Labels with 'ggplot2'
library(RColorBrewer) # ColorBrewer Palettes
library(grid) # The Grid Graphics Package
library(scales) # Scale Functions for Visualization2、加载数据（随机编写，无实际意义）并根据要求计算、处理数据：
##加载数据（随机编写，无实际意义）
#数据具体处理方式见单组火山图的绘制
df <- read.table("data.txt", header = 1, check.names = F, sep = "\t")
##确定顺序
df$group <- factor(df$group, levels = c("S1-S2", "S1-S3", "S1-S4",
"S2-S3", "S2-S4", "S3-S4"))
##与之前绘制单组火山图一致，先根据设定阈值确定所有OTU的显著性
df$group2<-as.factor(ifelse(df$p_value < 0.05 & abs(df$log2FC) >= 2,
ifelse(df$log2FC>= 2 ,'up','down'),'NS'))
df$group2 <- factor(df$group2, levels = c("up", "down", "NS"))
##确定添加标签的数据
df$label<-ifelse(df$p_value<0.05&abs(df$log2FC)>=4,"Y","N")
df$label<-ifelse(df$label == 'Y', as.character(df$OTU), '')
##按照log2FC列是否大于0进行区分
df$G <- ifelse(df$log2FC>=0, "Sigdown","Sigup")
##为了构建图形中所有数据点背景框，需要先确定每个组的最大值与最小值
df_bg <- df %>%
group_by(group) %>%
summarize(max_log2FC = max(log2FC),min_log2FC = min(log2FC))3、绘图模板展示（模板部分注释源码及原始测试数据可在公众号后台查看具体获取方式）：
最后在AI中进行细节调整可得到如下效果图：
需要附带注释的源码及测试数据请查看下方绘图模板获取方式！！
PS: 以上内容是小编个人学习代码笔记分享，仅供参考学习，欢迎大家一起交流学习。
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