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文献图片展示：
1、加载R包（未安装需要自行安装）：
library(ggplot2) # Create Elegant Data Visualisations Using the Grammar of Graphics
library(gghalves) # Compose Half-Half Plots Using Your Favourite Geoms2、加载数据（随机编写，无实际意义）：
##加载数据(随机编写，无实际意义)
df <- read.table("data.txt", header = 1, check.names = F, sep = "\t")
df$Group <- factor(df$Group, levels = c("Control", "Experiment"))3、绘图模板展示（模板部分注释源码及原始测试数据可在公众号后台查看具体获取方式）：
1）进阶一：箱线图+小提琴+散点分别显示
ggplot(data = df,
aes(x=Group, y=Value, fill = Group, color = Group))+
geom_half_violin(position=position_nudge(x=-0.1),
side='l',adjust=1.2,trim=F, alpha = 0.8)+
geom_point(aes(x = as.numeric(Group)+0.2, y = Value, color = Group),
position = position_jitter(width = 0.1),
size = 1.5)+
geom_boxplot(outlier.shape = NA,width = 0.1,color="black")+
facet_wrap(~Period)+
scale_fill_manual(values = c("#0099cc","#ff9933"))+
scale_color_manual(values = c("#0099cc","#ff9933"))+
labs(x=NULL,y="This is y-axis")+
theme_bw()+
theme(legend.position = "none",
legend.background = element_blank(),
axis.text = element_text(color = 'black',size=9),
axis.text.x = element_text(angle = 45, vjust = 1, hjust = 1),
axis.title = element_text(size=13))
2）进阶二：以并列图形式显示
ggplot(data = df,
aes(x=1, y=Value, fill = Group, color = Group))+
geom_half_violin(position=position_nudge(x=-0.08),
side='l',adjust=1.2,trim=F, alpha = 0.4)+
geom_point(aes(x = 1.15, y = Value, color = Group),
position = position_jitter(width = 0.05),
size = 1.5)+
geom_boxplot(outlier.shape = NA,width = 0.15,color="black")+
facet_wrap(~Period)+
scale_fill_manual(values = c("#0099cc","#ff9933"))+
scale_color_manual(values = c("#0099cc","#ff9933"))+
labs(x=NULL,y="This is y-axis",fill=NULL, color=NULL)+
theme_bw()+
theme(legend.position = c(0.1,0.85),
legend.background = element_blank(),
axis.text = element_text(color = 'black',size=9),
axis.text.x = element_blank(),
axis.ticks.x = element_blank(),
axis.title = element_text(size=13))需要附带注释的源码及测试数据请查看下方绘图模板获取方式！！
PS: 以上内容是小编个人学习代码笔记分享，仅供参考学习，欢迎大家一起交流学习。
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