「R绘图模板」气泡图+分组+标签+拟合曲线!!!

文摘   科学   2024-09-09 09:05   宁夏  





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文献图片展示:


1、加载R包(未安装需要自行安装):

library(ggplot2) # Create Elegant Data Visualisations Using the Grammar of Graphics
library(dplyr) # A Grammar of Data Manipulation
library(ggrepel) # Automatically Position Non-Overlapping Text Labels with'

2、加载数据(随机编写,无实际意义)并根据要求计算、处理数据:

###加载原始数据(随机编写,无实际意义)
df <- read.table(file="data.txt",sep="\t",header=T,check.names=FALSE)

3、绘图模板展示(模板部分注释源码及原始测试数据可在公众号后台查看具体获取方式)

df %>% 
  ggplot(aes(`Infection rate of rice blast in 2023 (%)`, 
             `Infection rate of rice blast in 2024 (%)`))+
  geom_point(aes(color = Group, size = Size, fill = Group),
             alpha = 0.6, shape = 21)+
  scale_size(range = c(1,10),name="Degree of growth")+
  guides(
    size = guide_legend(
      override.aes = list(size = seq(1, 10, length.out = 4))
    ),
    fill = guide_legend(
      override.aes = list(size = 7, shape = 20)
    )
  )+
  scale_fill_manual(values = c("#E64B35FF","#4DBBD5FF","#00A087FF","#3C5488FF"))+
  scale_color_manual(values = c("#E64B35FF","#4DBBD5FF","#00A087FF","#3C5488FF"))+
  geom_smooth(method = "lm", se=T, 
              formula = y ~ x,
              linetype=5,color="black",lwd=0.6,
              fill="grey",alpha=0.3)+
  geom_text_repel(aes(label=Sample, color = Group),
                  max.overlaps = 10000,
                  size=3,
                  box.padding=unit(0.5,'lines'),
                  point.padding=unit(0.5, 'lines'),
                  segment.color='black',
                  show.legend=FALSE)+
  theme_bw()+
  theme(panel.grid = element_blank(),
        axis.text = element_text(size = 10, colour = "black"),
        axis.title = element_text(size = 13, colour = "black"),
        legend.position = c(0.12,0.65),
        legend.background = element_blank())

需要附带注释的源码及测试数据请查看下方绘图模板获取方式!!

PS: 以上内容是小编个人学习代码笔记分享,仅供参考学习,欢迎大家一起交流学习。 

R绘图模板合集(包括附带注释的源码、测试数据及绘制效果图)可在公众号后台菜单栏→R代码查看具体获取方式!

绘图模板合集效果图展示:




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