Vegetable Res 精选2023 | 湖南农业大学系统分析了根系发育和胁迫相关的CsMYB36基因的全基因组特征和鉴定

文摘   三农   2024-11-15 15:30   江苏  



我国黄瓜种植面积和产量稳居“世界第一”,因此黄瓜是中国大部分地区调整产业结构、实现农民增收、促进农村经济发展的支柱产业。根系在植物生长发育和营养吸收中起着重要作用,影响作物产量,并参与植物与非生物胁迫信号之间的传递。然而,对黄瓜根系发育和响应胁迫相关重要基因的挖掘却非常有限。


2023年6月,Vegetable Research 在线发表了湖南农业大学黄瓜种质创新与遗传改良团队题为Genome-wide characterization and identification of root development and stress-related CsMYB36 genes 的研究论文。该研究对黄瓜进行了全基因组范围内CsMYB36基因家族的鉴定,并进行了系统比较分析


MYB36是参与植物整个发育过程中的一个关键转录因子,为了挖掘黄瓜中MYB36在根系发育中潜在功能以及对逆境胁迫的响应,该研究通过系比较分析在黄瓜基因组中共鉴定了15个CsMYB36。其中,表达特性分析发现CsaV3_2G008030.1和CsaV3_3G036040.1很可能调控根系的凯氏带形成。此外,所有的CsMYB36s启动子都含有厌氧诱导元件,通过水涝胁迫以及qRT-PCR分析结果表明:其12个CsMYB36s 均响应水涝胁迫,暗示CsMYB36在水涝胁迫中很可能发挥重要功能,我们还发现了一个潜在的候选CsMYB36

(CsaV3_1G013560.1)

,它参与了高温胁迫反应。这项工作为了解黄瓜中CsMYB36 基因家族的特点提供了宝贵的信息,并为研究人员研究根系凯氏带的形成和高温、水涝胁迫提供了新的线索。

图1 MYB36进化树分析


图2 CsMYB36 水涝胁迫下的相对表达水平


湖南农业大学园艺学院王春华教授为论文第一作者,在读硕士研究生沈茜为论文的共同第一作者,武涛教授为通讯作者。这项工作得到了国家重点研发计划

(2022YFD1200502)

、国家自然科学基金

(32211540386)

以及湖南省科技创新计划项目

(2022RC1143)

等项目的支持。

原文链接:
https://doi.org/10.48130/VR-2023-0019
VR-2023-0019.pdf

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Vegetable Research 是一本开放获取的期刊,致力于传播蔬菜作物研究进展。欢迎蔬菜研究所有领域的原始研究论文、方法、资源和综述等投稿,主题范围包括(但不限于)遗传、育种、组学、分子生物学、生物技术、与环境和其他生物系统的相互作用以及采收前后的生产。期刊主编由中国农业大学张小兰教授和法国图卢兹国立理工学院Julien Pirrello博士共同担任。目前期刊已被ESCIScopusCABI等数据库收录。


期刊官网:
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投稿网址:
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