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摘 要
老化是一个复杂的过程,其特征在于生理功能的逐渐下降,导致对与年龄相关疾病的易感性增加和生活质量的降低。DNA甲基化(DNAm)模式的改变是人类皮肤老化的基本特征之一,并与皮肤老化表型的发生和发展密切相关。这些变化与基因表达失调和组织功能受损密切相关。皮肤,作为老化的可见表现,提供了一个独特的模型来研究老化过程。尽管表观遗传时钟通过甲基化模式与年龄之间的相关性来估算生物学年龄,且其重要性不言而喻,但仍缺乏一种能够将DNA甲基化模式与特定表型相关联的第二代表观遗传时钟,特别是专门针对皮肤组织的。为了填补这一空白,我们的目标是开发一种新的第二代表观遗传时钟,它专门为皮肤组织设计,以更深入地了解导致老化进程个体差异的因素。我们利用370多名女性的甲基化模式,开发了第一个皮肤特异性的第二代表观遗传时钟,准确预测了由皱纹等级、视觉面部年龄和视觉老化进程分别代表的皮肤老化表型。随后,我们在独立数据集上验证了该时钟的性能,并展示了其广泛的应用前景。此外,我们还整合了来自独立研究的基因表达和甲基化数据,以识别可能导致皮肤老化的潜在途径。我们的结果表明,此表观遗传时钟VisAgeX特别能够预测视觉皮肤老化进程,不仅捕捉了与皮肤老化相关的已知生物学途径,还发现了新的相关途径。