课程简介
本课程专为病原微生物微生物学研究人员而开发,课程深入讲解了ABRicate软件的安装与使用,演示和解读了预测微生物的抗性基因和毒力基因的具体方法。ABRicate是一款功能强大的工具,集成了多个权威数据库,包括:
NCBI AMRFinderPlus NCBI耐药数据库 CARD 综合性的耐药数据库
Resfinder耐药数据库
ARG-ANNOT 非冗余耐药数据库
MEGARES 人工校正的抗性基因数据库,包括抗生素抗性基因,杀虫剂抗性基因以及重金属抗性基因
EcOH 大肠杆菌O/H抗原数据库
PlasmidFinder 质粒数据库
VFDB 毒力基因数据库
Ecoli_VF 大肠杆菌毒力因子预测
课程内容
课程获取方式