研究透视:立体化学-蛋白质相互作用 | Nature

文摘   2024-11-29 00:02   北京  

内在无序的蛋白质,可通过形成高度无序的蛋白质复合物,而不是形成三维结构。大多数天然存在的蛋白质是左旋的levorotatory (l)——即仅由L-氨基酸组成——印迹分子结构和立体化学通讯。然而在自然界中,镜像右旋dextrorotatory (d)-氨基酸是罕见的。无序蛋白质复合物是否真正独立于手性限制,尚不清楚。

近日,丹麦 哥本哈根大学 (University of Copenhagen)Estella A. Newcombe, Amanda D. Due,Birthe B. Kragelund等,在Nature上发文,为了研究无序蛋白质-蛋白质相互作用的手性限制,选择了一组无序-有序连续体的五个相互作用蛋白质对,为代表性的例子。
通过观察天然配体及其在自由态和束缚态下的立体化学镜像,研究发现,在完全无序的复合物中,手性是无关紧要的。然而,如果相互作用依赖于配体经历广泛的偶联折叠和结合,则正确的立体化学是必要的。在这些极端之间,可观察到镜像右旋d-配体的结合,强度与最终复合物中的无序相关。
这些发现,提升了复合物形成的分子过程、D-肽在药物发现中的应用,以及地球上第一个生命体的蛋白质进化化学,具有重要意义。

Stereochemistry in the disorder–order continuum of protein interactions. 

蛋白质相互作用的无序-有序连续体中的立体化学。



图1: 在蛋白质-蛋白质相互作用中的手性。


图2:手性对蛋白质相互作用的影响。


图3: RCD1–SRO–TAF4,RST与L-肽和D-肽的相互作用,随复合物中剩余的紊乱而变化。


图4: 结合d-对映体的能力与复合物的无序性成比例。

文献链接
Newcombe, E.A., Due, A.D., Sottini, A. et al. Stereochemistry in the disorder–order continuum of protein interactions. Nature (2024). 
https://doi.org/10.1038/s41586-024-08271-6
https://www.nature.com/articles/s41586-024-08271-6
本文译自Nature。
来源:今日新材料
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