山脊图实在美丽,速来一探究竟!

企业   2024-08-31 10:03   中国  


1、山脊图的适用场景

山脊图(Ridge Plot)是一种用于展示多个分布的叠加效果的可视化方法。它常常用于比较或不同样本、或不同时期、或不同组别的数据分布,也用来展示时间序列数据的趋势。在图形中,每个分布使用密度曲线表示,根据数据的特点会在垂直方向上有一定偏移,呈现出一系列重叠的山脊效果,形象而直观。山脊图能够清晰展示每个数据分布的形状和趋势,便于我们直观地比较不同组别之间的差异。


2 、输入数据示例

输入的数据通常为不同组别的数据分布。例如,蓝色框部分为样本名称,每一列代表一个样本的数据分布;绿色框部分则为具体的数据值。第一列不涉及绘图需要,仅用于记录,可自由更改/填充。数据可以来源于实验结果、统计分析或其他类型的数值集合。



3、使用云工具绘制山脊图

在联川生物云平台(https://www.omicstudio.cn/tool)中的云工具栏搜索“山脊图”( https://www.omicstudio.cn/tool/163)可快速找到该云工具。界面及云工具示例如下:



4、云工具介绍

4.1 
输入数据栏。点击“上传文件”处上传自己的文件,下方会展示输入数据的前6 行。如不确定数据格式,请点击“示例文件下载”查看示例数据,或使用当前的示例数据进行探索。


4.2 
图形展示栏。输入不同的数据或调整参数,中间的图形展示会随之即刻变化。


4.3 

结果下载栏。可以通过右侧结果下载模块进行下载。可自定义输出文件的文件名,可通过输出文件类型选择需要的图片格式(支持pdf/png/svg/tiff格式),可调节图片的高度和宽度,中间图形的形态会随着右侧“输出图片的高度/宽度”的值而发生变化,可供参考,调整完成后,可点击“下载图片”按钮下载图片。另外也可点击“下载标准化数据”按钮下载处理后的、用于绘图的数据(标准化方式在左侧数据处理栏可选)。


4.4 

其他参数调整。在“数据处理”子版块可选择对输入数据进行标准化处理,并可以自由规定x轴的范围;在“标签设置”的子版块可对主标题、轴标题、图例以及字形字体等进行个性化处理;在“主题设置”子版块可选择绘图的颜色面板(每个组别的颜色也可以单独设定)、透明度以及轮廓线的设置等等。每一步参数变化,图形都会即刻随之变换。


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