翻译组揭示水稻节水处理下生长胁迫的发生机制

企业   2024-09-12 17:01   浙江  


论文标题:Mitigating growth-stress tradeoffs via elevated TOR signaling in rice

刊登日期:2023年12月

发表杂志:Molecular Plant

影响因子:17.1

研究机构:浙江大学


 

研究背景 

  

传统的水稻生产占农业利用淡水资源的50%,同时水稻田被淹会产生甲烷(CH4)等温室气体,导致全球气候变暖问题日益严重。此外,传统的水稻种植灌溉方式不仅消耗大量水资源,还会导致肥料流失、土壤盐碱化和水污染等不利因素。为了应对这一挑战,研究人员开始探索节水水稻种植技术。尽管节水水稻种植技术在减少水资源消耗方面取得了进展,但其在实际应用中产量潜力和氮利用效率(NUE)都有降低,阻碍了节水水稻的推广应用。并且,节水条件下产量损失和氮利用率降低的分子机制尚不清楚。因此,研究者需要深入理解植物如何在水分限制条件下适应,并寻找提高节水型水稻产量和氮利用效率的策略。
雷帕霉素靶蛋白(target of rapamycin, TOR)在植物和动物中作为发育调节因子广泛存在,它在能量供应充足时促进与合成代谢相关的基因上调,而在能量供应不足时则抑制这些基因。因此,研究TOR信号通路在水稻适应水分限制条件下的作用具有重要意义。
      
 
    

 

技术路线

 

         

 

         

 

 

主要结果

 

1、节水处理抑制TOR活性及其调控的蛋白翻译,降低水稻产量
该研究发现,在节水处理(WST)情况下,水稻光合作用速率、分蘖数、株高、生物量、产量均显著降低。并且WST下总蛋白的积累显著减少,表明WST后蛋白质翻译可能减少。以上现象可能是TOR蛋白活性受到抑制所导致。通过不同TOR表达的转基因植株发现,TOR促进了植物生长,缓解了WST造成的生长迟缓。
TOR在翻译调控中起着至关重要的作用,该研究通过翻译组测序(polysome-seq),鉴定到有274 个基因被WST和低TOR活性条件共同抑制,但是这些抑制在TOR-OE植株中显著减轻。其中,87种参与保守翻译和氮利用的WST抑制基因与TOR活性相关。通过qPCR实验也验证了上述结果。后续通过一些生理指标的测量表明,TOR可能通过增强参与氮吸收和分配的蛋白质的翻译来缓解WST引起的生长抑制。
         

 

   
         

 

         

 

2、WST抑制TOR-S6K-RPS6信号调控的翻译
之前的研究表明,RPS6会在不同条件下被TOR-S6K信号磷酸化,并在调节翻译中起着至关重要的作用。因此本研究通过体外实验证实,水稻的RPS6a是S6K1的直接底物,并且其磷酸化受TOR活性的影响。通过构建RPS6a突变体发现,正常情况下与WT无差异,WST情况下RPS6a突变体表现出较短的茎长和较少的生物量,同时Ploysome RNA的相对比例显著降低,表明RPS6是WST期间必不可少的生长调节剂。    
         

 

3、TOR抑制MAF1促进tRNA合成
MAF1是RNA聚合酶III (RNA Pol III)的保守抑制因子,通过控制tRNA的合成来影响蛋白质翻译。本研究通过体外激酶实验,证明了MAF1可以作为水稻中TOR的底物发挥作用。通过构建MAF1突变体和体内外实验发现,TOR-MAF1模块调节WST下tRNA前体的合成,水稻中TOR的过表达可通过磷酸化抑制MAF1,反过来增强了tRNA的生物发生和随后的蛋白质合成,缓解WST引起的生长抑制。    
         

 

4、TOR调节与氮吸收和分配相关的mRNA的翻译
前面的翻译组测序结果表明,在WST下,AAP1、NPF7.3和AMT1;1基因的翻译被抑制,这三个基因已被证明可提高氮肥利用率来提高水稻产量。然而,它们是否参与节水条件下氮的吸收和分配,以及是否受TOR调节尚不清楚。该研究通过实验表明,TOR可以增强与氮吸收和分配相关的特定mRNA的翻译。
         

 

   
         

 

5、WST下,TOR通过增加氮分配和铵吸收来提高氮素利用效率
进一步研究发现,TOR 还可以控制 AAP1、NPF7.3 和 AMT1;1 等基因的5’UTR区调节与NH4+的吸收和分配相关蛋白质合成。这种调节保证了水稻对NH4+的正常吸收和利用,进而促进TOR活性并保证水稻的正常生长。
         

 

         

 

 

结论与意义

 

该研究发现,在WST情况下,TOR活性受到抑制。这种抑制导致MAF1磷酸化程度变高,S6K-RPS6信号传导也受到抑制,使得tRNA生物发生和蛋白质翻译效率受到影响。此外,AAP1、NPF7.3和AMT1;1的翻译也受到特异抑制,导致NH4+吸收和氮分配效率降低,从而降低氮利用效率和蛋白质合成,最终导致WST下水稻生长迟缓和生物量减少。    
该研究探索了TOR信号通路在调节水稻对节水胁迫响应中的作用,并提出了一种新的策略,通过适度增强TOR信号改善水稻在节水条件下的生长和产量,促进全球低碳农业的发展,这也为培育具有提高水和肥料利用效率的新水稻品种提供了可能。
         

 

    

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