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强大、无偏且低成本的4D-蛋白质组学技术应用于超高特异性的蛋白质鉴定与定量,可实现高置信度的大规模血浆蛋白质组学分析。
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每种细胞系可以鉴定超过10万条多肽,每种蛋白质鉴定对应超过10条多肽,高序列覆盖率显著提升蛋白鉴定置信度,实现超高特异性的蛋白质组学分析(HiFi Proteomics)。
A
全新diagonal-PASEF®采集模式,可应用于免疫肽组学和蛋白翻译后修饰分析。
B
100美元即可实现高置信血浆蛋白质组学,使用PreOmics ENRICH™试剂盒和稳健的timsTOF HT质谱平台,可以进行深度、无偏的大规模血浆蛋白质组学研究,特异性高达99%(1% FDR);
与此同时,Biognosys推出了P2富集策略和Spectronaut® 19数据分析整体服务,用于超高深度血浆蛋白质组学,可鉴定出7000-9000种蛋白质;也可选择整合Alamar Bio公司的超高灵敏度NULISA® inflammation和CNS multiplex panel 试剂盒。
C
结合Glyco-PASEF®数据采集模式、ENRICHplus试剂盒和GlycoScape™分析软件可在timsTOF Ultra 2上实现超高灵敏度血浆糖肽分析。
D
基于机器学习加持的TIMSrescore™算法可以提升免疫肽组学和蛋白翻译后修饰鉴定数目;同时可以实现超高置信宏蛋白质组学研究(0.1% FDR)。
E
整合蛋白质组学、脂质组学和代谢组学分析视角,推动4D-多组学技术的发展。
2024年10月21日德国德累斯顿 —— 布鲁克(纳斯达克股票代码:BRKR)在第23届人类蛋白质组组织世界大会(HUPO 2024)上,发布了其在深度、无偏和高灵敏度4D-蛋白质组学方面取得的进展,将为稳健、高置信度、大规模的组学研究提供帮助。
2023年, Dr. Matthias Mann(德国马普所)和Dr. Stefan Tenzer(美因茨大学)两位关键合作者,利用扫描四极杆和捕集离子淌度技术(TIMS),开发了全新的diagonal-PASEF®扫描技术,他们还分别开发了synchro-PASEF®和midia-PASEF®技术。在布鲁克及合作伙伴的共同努力下,现在Spectronaut®19、DIA-NN 1.9、MaxQuant 2.6.3和midiaID软件可以支持不同采集模式原始数据解析。
Synchro-PASEF®凭借更高离子利用率、更短循环时间、多达3倍的信号强度提升等优势,可以实现高通量数据采集,同时确保定量精度。
midia-PASEF®通过提取类似DDA的谱图进行从头测序分析,并对海量数据库进行搜索,从而给出更高置信度的免疫肽组学和翻译后修饰信息。
布鲁克公司引领高深度、无偏的血浆蛋白质组分析,具有高通量、高置信度优势,并为大规模研究提供经济可行的研究方案。PreOmics ENRICH-iST或ENRICHplus试剂盒、timsTOF HT稳健且准确(99%特异性,1% FDR)的蛋白质鉴定与Spectronaut®19相结合,可实现高深度、无偏、高置信度的大规模血浆蛋白质组学研究,每个血浆样品的成本可低至100美元。[PreOmics]
生物制药公司可以通过Biognosys提供的研究服务,使用其专有的P2超深度血浆富集技术,在血浆蛋白质组研究中实现7000种蛋白质的鉴定深度,在较低通量下可达9000种。[Biognosys]
布鲁克公司与根特大学Lennart Martens博士团队共同开发了TIMSrescore算法。借助机器学习技术分析碰撞截面、保留时间和碎片离子强度,TIMSrescore可为dda-PASEF®提供高置信度的肽段鉴定。在蛋白质翻译后修饰和宏蛋白质组学分析中,超高置信度和卡值条件(99.9%特异性和0.1% FDR)对于区分高度相似的蛋白质尤为重要。
根特大学医学中心生物信息学副主任Lennart Martens博士表示:“我们的团队很高兴看到蛋白质组学界对于TIMS²Rescore的认可。通过与布鲁克ProteoScape™软件集成,将MS2rescore扩展到timsTOF用户端,使我们基于机器学习的信息能够最大化4D-蛋白质组学的价值”。
牛津大学副教授Roman Fischer博士评论道:“我们使用timsTOF进行蛋白质组和脂质组研究。ProteoScape™和MetaboScape®的实时分析能力非常强,能够将数据转化为生物学信息。布鲁克现在通过交互式多组学可视化和统计分析整合了这两个领域,向前跨越了很大一步。”