探索 MALDI 质谱成像新视野 —— SCiLS™ Scope

科技   2024-08-02 11:20   上海  
布鲁克公司于今年ASMS推出了一款全新的成像可视化分析软件——SCiLS™ Scope,这款软件专为MALDI质谱成像和MALDI HiPLEX-IHC(多重免疫蛋白成像)工作流程而设计,它集成了优化设计的空间可视化分析功能模块,为具有病理学意义的靶标蛋白质的空间分布研究提供了全新的视角。界面简洁,易于操作,采用开放式的OME-TIFF格式的图像文件,便于在生物医学研究领域使用、推广及科研共享。

MALDI(基质辅助激光解吸/电离)质谱成像是一种免标记、高通量的原位分子成像技术。随着空间组学概念的推广,MALDI成像已逐步成为生物体系空间组学分析的重要手段。它广泛用于对组织中的代谢物、脂质、糖类等小分子化合物的空间分布表征。布鲁克于2022年推出了MALDI HiPLEX-IHC工作流程,将MALDI质谱成像技术与经典的IHC相结合,形成了多重抗原检测结合质谱成像的一站式解决方案。它预先在抗体上连接设计好的肽质量标签(PC-MT),经过抗体跟抗原的特异性反应,肽质量标签就会“聚集”在目标抗原位置,再通过MALDI质谱成像技术检测肽质量标签特征片段,就可以以高通量的检测方式、给出多种目标抗原的空间分布信息。MALDI HiPLEX-IHC在靶标蛋白质的分析领域展现出巨大的潜力,为疾病相关的蛋白质组学研究、组织病理学、组织诊断等领域提供了全新的分析工具。

布鲁克公司在原有SCiLS™ Lab软件的基础上,结合客户的使用需求、并通过进一步的模块优化,推出了SCiLS™ Scope可视化软件,它具有直观的界面和强大的可视化功能,并进一步简化了数据共享和分析过程。无论是经验丰富的研究人员,还是初次接触MALDI成像的新手,都能快速上手,专注于数据分析和分子图像的呈现。


实验部分



样本制备:遵循AmberGen的标准流程,包括组织准备、抗原检索、带有光裂解质量标签的抗体染色,确保样本质量和数据的可靠性。


图1. MALDI HiPLEX-IHC工作流程

自动化数据获取:SCiLS™ autopilot自动一体化的工作流程简化了OME-TIFF文件的创建过程,确保数据的准确性和一致性。


图2. neofleX™数据采集与SCiLS™ Scope成像数据可视化工作流程

数据可视化软件支持多种方式查看数据,包括单个分子通道的独立分析和多分子通道的协同分析,使研究人员能够以更高的灵活度分析和展示成像数据。


图3. SCiLS™ Scope主要功能显示:A. 多通道叠加视图,B. 多通道的选择,C. 亮度和对比度调整

全新的功能模块:连续的放大功能、距离测量、亮度和对比度调整等功能,使得SCiLS™ Scope在同类软件中脱颖而出。


图4. SCiLS™ Scope主要功能显示:A. 单通道平铺视图,B. 局部放大图,C. 距离测量

在图3和图4呈现的是在结直肠癌FFPE样本的MALDI HiPLEX-IHC实验结果,SCiLS™ Scope成功展示了14个蛋白质通道的分析结果,其中6个通道被可视化展示。这一案例不仅证明了软件强大的可视化功能,也展示了其在临床科研中的应用潜力。研究人员能够清晰地观察到靶标蛋白质在组织中的空间分布情况及相对位置关系,为疾病的诊断、治疗及发病机制研究提供了更多的参考。

兼容性:SCiLS™ Scope可读取的OME-TIFF 文件由neofleX™或timsTOF fleX系列质谱仪支持创建,MALDI成像数据通过flexControl 5.0或timsControl 5.1采集,OME-TIFF文件通过flexImaging 7.4和SCiLS Lab 2024b自动创建,或通过SCiLS™ Lab 2024b对原始数据(*.mis)进行详细审查和手动OME-TIFF导出。

结论



布鲁克的SCiLS™ Scope作为一款全新的MALDI成像可视化分析软件,它的引入使得多分子通道快速分析及平行展示成为可能。SCiLS™Scope简化了图像概览和图像调整操作,使得研究人员能够更高效地进行数据分析、共享及学术交流。SCiLS™ Scope的灵活易用性和多功能性将极大地促进MALDI成像技术在生物医学研究领域的推广和应用。


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布鲁克质谱
布鲁克公司质谱部事业研发生产各类先进质谱,主要包括: timsTOF、MALDI-TOF、QTOF和MRMS等。同时,我们还开发了蛋白质组学、代谢组学、生物制药、质谱成像等一系列解决方案和软件产品。
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