真实样本分析,带您探秘4D-脂质组学技术

科技   科学   2024-06-27 11:28   上海  

IMSC Poster#布鲁克创新方案

VIP-HESI结合timsTOF技术

提高4D-多组学的检测灵敏度,为高分辨质谱开辟了新的应用空间





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前言





类二十烷酸,也称为类花生酸,是人体重要的信号分子,与炎症等病理过程密切相关。通常情况下,类二十烷酸可以在尿液或亲脂性提取物中被检测到。羟基二十四烯酸(HETE)属于二十烷酸的一个亚类,是许多生物活性代谢物的关键前体。由于其化学结构如15(S)-HETE或20-HETE相对不稳定,因此需要优化LC-MS分析方法以实现温和的去溶剂化和电离。本文介绍了布鲁克新型VIP-HESI双离子源有效提高类二十烷酸分析的灵敏度,创新的捕集离子淌度 (TIMS) 技术利用高度可重现的碰撞横截面积 (CCS),实现代谢物的高置信度注释。



图1. VIP-HESI离子源

真空绝热喷针-可加热电喷雾电离离子源 (VIP-HESI) 已在EVOQ三重四级杆质谱上有着出色表现,这一技术现完美应用在timsTOF和QTOF系列质谱上,将灵敏度提高5~15倍。VIP-HESI双离子源采用高效陶瓷加热器技术及真空绝热设计,对于不稳定化合物分析至关重要;此外,通过“主动排空”功能,可以保持离子源持续清洁,有效应对大批量的样品分析。VIP-HESI结合离子淌度技术提高4D-代谢组学和4D-脂质组学的检测灵敏度,为高分辨质谱开辟了新的应用空间;结合布鲁克TASQ及MetaboScape软件,为客户持续提供易用、稳定的高分辨LC-MS解决方案。



图2. 4D-脂质组学


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实验设计





类二十烷酸标准品使用MeOH/ACN/H2O/0.1% FA (47%/47%/6%) 稀释获得梯度稀释液(0.1-1000ng/mL),随后将不同浓度的标准品添加至稀释的尿液中(1:100), 样品采用布鲁克Elute UHPLC串联timsTOF Pro 2质谱进行分离与检测。


色谱分离条件

采用布鲁克Intensity Solo HPLC色谱柱(C18,2x100mm),柱温50°C,溶剂A:0.1% FA H2O,溶剂B:0.1% FA ACN,流速为0.4mL/min,进样量为2μL。液相梯度运行总时间为6min,线性梯度由2% B(0.5 min)到100% B(4min)及1min清洗和1min平衡。


质谱检测条件

4D ESI (-) -MS数据是通过TIMS-MS获得。使用常规ESI和加热的VIP-HESI离子源,在PASEF模式 (DDA-TIMS-MS/MS) 下进行数据采集,降低源气和电压设置,以实现温和的去溶剂化。

数据处理

利用TASQ 2023和MetaboScape 2023软件(Bruker)进行数据处理,使用包含化合物名称和分子式的Target List进行尿液代谢物的注释,同时,根据结构信息(InChI Code)模拟二级图谱及预测CCS值。

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实验结果





准的PASEF方法的Duty Cycle为0.3s(每个100ms采集 1 MS+2 MS/MS)。因此,在总运行时间为6分钟的液相色谱梯度中, 2.5s的液相色谱峰上约包含7-8个MS数据点。图3比较了羟基二十四烯酸分别应用ESI和VIP-HESI源的采集数据。对于标准电喷雾电离,1ng/mL是最低可检测的浓度水平,在使用VIP-HESI源后,羟基二十四烯酸的LOD从1ng/mL提高到0.3ng/mL,其LOD降低了3-4倍。

值得注意的是,即使在如此低浓度的水平下,CCS值偏差均小于2% [Å2]。因此,利用经离子淌度过滤后所产生的更干净的色谱图及MS/MS图谱(图4和图5) ,提高了定向筛选的数据质量。除根据数据库中的CCS值进行比较,也可以根据化学结构预测CCS值,提高非靶向研究中的注释质量。



图3. 羟基二十四烯酸 (HETE) 在ESI源 (左)及VIP-HESI 源 (右)采集数据比较



图4. 20-HETE、15(S)-HETE和12(S)-HETE的PASEF MS/MS图谱



图5. 蛋白酶解肽段的MALDI-2成像热图。(B) 胶原蛋白酶解肽段的MALDI-2质谱图。使用标准PASEF方法获得的HETE淌度图谱

利用MetaboScape软件对尿液中的内源性化合物进行非靶向分析,根据20-HETE的结构信息(InChI Code)预测CCS值及模拟MS/MS图谱。特别是在使用"低质量"数据库时,MetaboScape可提高Feature注释的可信度,简化了审查结果和去除假阳性的过程。为了增加注释完整性,基于HMDB的Target List(>4700个化合物)用于加标尿液数据的注释。



图6. 注释质量的可视化报告

如图6所示,MetaboScape拥有可视化注释质量系统,匹配情况在AQ图标中得到清晰体现。用户可自定义CCS值、m/z、mSigma、MS/MS Score的阈值范围,如果数据位于一个宽(Wide)/窄(Narrow)的范围内,则在相应的列中用一个/两个条形显示。右侧列表显示仅基于元素组成的特征注释(上)和基于元素组成以及与计算出的CCS值和MS/MS谱图(下)的匹配情况,根据AQ符号显示图形可知,利用后者可显著提高的Feature注释的置信度。



图7. 利用in-silico获得的MS/MS谱图注释(左)、将MS/MS与Spectral Library的谱图相匹配 (中)、自动匹配预测的CCS值,由此产生的偏差可以用来区分假阳性。

如果将元素组成(即使用m/z和 mSigma)作为唯一鉴定选项,则注释超过300个,由于数目较大,需要进一步分析检查。另外,包含附加结构信息(InChI Code)的上述数据库返回约130个独特的注释,虽然当前结果仍需检查,但是由于使用了计算机模拟的CCS值和二级谱图,这些结果更加可靠。总而言之,使用自动化预测工具增加了用户对所获得结果的信心。

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结论





VIP-HESI双离子源结合离子淌度技术提高了类二十烷酸分析的灵敏度和注释质量:
  • 基于加热的新型VIP-HESI双离子源提高了类二十烷酸的灵敏度;

  • CCS值引入提高了Feature注释质量;

  • 使用结构信息有助于利用"低质量Target List"进行非靶向分析。

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布鲁克质谱
布鲁克公司质谱部事业研发生产各类先进质谱,主要包括: timsTOF、MALDI-TOF、QTOF和MRMS等。同时,我们还开发了蛋白质组学、代谢组学、生物制药、质谱成像等一系列解决方案和软件产品。
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