随着第1000套timsTOF的安装,再次彰显布鲁克在高端前沿质谱领域获得的巨大成功。近年来,布鲁克在单细胞组学、4D多组学、空间定位组学、质谱成像等领域不断实现技术突破,在 2024 ASMS上布鲁克不仅推出更高灵敏度的timsTOF Ultra 2, 在空间定位组学领域又推出了性能强大更易用的台式MALDI-TOF neofleX™,同时推出多款样本前处理、耗材以及配套软件方案,它们正一同构建布鲁克后基因组学研究的强大组学生态系统。ASMS期间,布鲁克生命科学质谱事业部总裁Rohan Thakur博士接受了分析测试百科的采访,为大家详解新品和已构建的强大组学生态系统,相信在中国新一轮的设备更新中,又会“种草”很多布鲁克的粉丝,接下来就让我们一睹为快吧。
图:分析测试百科网总经理卞利萍女士分别同布鲁克生命科学质谱事业部总裁Rohan Thakur博士(上图,右)以及布鲁克生命科学质谱中国区总经理何磊(下图,右)合影
谈到ASMS期间的活动,Rohan兴奋地说:“周日的用户会是历年来出席人数最多的用户会;布鲁克所有的早餐研讨会都是超额报名,比如蛋白质组学早餐会预订了90人的房间,到场180多人,用户反响非常热烈。布鲁克的Hospitality Suite在会期全天开放,不停地迎接感兴趣的客户,晚上的气氛也非常热烈。”
布鲁克公司在本届ASMS大会发布了两款重磅质谱产品 —— neofleX™和timsTOF Ultra 2。neofleX™ MALDI-TOF/TOF 台式空间成像质谱仪专为速度和灵活性而设计,推动质谱成像与其他领域的成果转化。timsTOF Ultra 2在去年timsTOF Ultra的基础上再次提升性能,是最高端的适合于单细胞蛋白质组学研究的质谱,同时扩展了常规蛋白质组学分析能力。(如欲了解详情,欢迎参加布鲁克新品线上推介会)图:neofleX™ MALDI-TOF/TOF空间成像质谱仪近年来,空间多组学分析成为研究热点,质谱成像是其中重要的解决方案。布鲁克是MALDI技术的先驱,拥有超过30年的MALDI研发经验,rapifleX® MALDI-TOF/TOF已在质谱成像研究中广受好评。今年推出的neofleX™ MALDI-TOF/TOF是一款高配置、多功能的台式空间成像质谱系统,专为生物制药、转化医学和临床科研而设计;它易于操作,非质谱专家也可以轻松操控,仅需将组织切片放入neofleX™中,稍做简单设置、按下按钮,既可快速得到成像结果。neofleX™ Imaging Profiler配备了布鲁克专利的smartbeam 3D激光器,确保了具有真实的“方形像素点”成像采集功能。结合MALDI HiPLEX-IHC工作流程可实现多重靶标蛋白质的空间成像分析,并与 AmberGen 公司的MALDI-ISH(原位杂交成像)方法兼容,后者可对多达12个目标寡核苷酸(RNA/DNA)进行多通道空间成像表征。
图:在neofleX™上通过MALDI-HiPLEX IHC工作流程对肺癌样本进行了116通道蛋白质空间成像:对照组、腺癌、鳞状细胞癌。数据由瑞士苏黎世大学和瑞士联邦理工学院的Bernd Bodenmiller教授提供neofleX™可实现多分子维度的MALDI成像解决方案:从靶标蛋白质、聚糖分子、代谢物、脂质、内源性多肽到mRNA/DNA的全景式空间表征及关联性探索;全新的SCiLS™ Scope软件提供OME-TIFF图像文件,可实现每一帧像素分子信息的最大化。neofleX™还与布鲁克的成像软件和成像耗材生态系统无缝兼容,例如IntelliSlides™、SCiLS autopilot和-SCiLS™ Scope,这些工具简化了样本追踪、实验准备和数据分析过程,用户只需进行最少的参数设置即可实现自动一体化成像采集流程。Rohan还强调了neofleX™在加速生物药物研发中的重要作用:MALDI 自上而下测序(MALDI-TDS)能够快速提供药物蛋白质的序列和修饰信息;在需要更高通量的常规应用中,neofleX™配合 BioPharma Compass®软件,能够轻松且快速获得众多类型生物分子的质控结果。图:布鲁克 timsTOF Ultra 2 捕集离子淌度质谱系统布鲁克timsTOF系列质谱系统获得了巨大成功,Rohan兴奋地说:“布鲁克已向客户发货超过1000套timsTOF系统。”新一代 timsTOF Ultra 2,与优化涡流设计的 CaptiveSpray Ultra 2 离子源相结合,树立了灵敏度新标杆,先进的diagonal-PASEF® 工作流程和第二代离子电荷控制(ICC 2.0)技术使得timsTOF Ultra 2适用于从超微量皮克到微克级别的宽上样量范围,大大提高了对微小细胞、亚细胞细胞器进行深度分析的灵敏度,并增加了样本进样量范围的灵活性。比如,仅需要25pg的蛋白酶解液,即相当于HeLa细胞蛋白量的1/10,鉴定和定量的蛋白数量增加50%,多肽数量增加高达100%。
结合优化AI功能的Spectronaut® 19软件和全新的单磁珠PreOmics ENRICHplus试剂盒,布鲁克正在建立从超高灵敏度到大规模深度血浆蛋白质组学的4D-蛋白质组学新标准。此外,布鲁克还推出了OmniScape™ 软件,用于完整蛋白的自上而下的序列确认和从头测序分析。glyco-PASEF®采集模式和 GlycoScape™分析软件可实现全新的4D-糖蛋白分析功能。Rohan表示,timsTOF Ultra 2 不仅具有超高灵敏度,还可进行timsTOF系列的持续升级。通过无缝集成最新技术,布鲁克为科研人员提供了灵活的选择,以适应不断变化的科研环境,使研究团队无需更换整个系统即可获得下一代质谱仪性能。图:timsTOF系列质谱仪升级途径:timsTOF SCP到timsTOF Ultra到 timsTOF Ultra 2
第42届摩根大通医疗健康峰会上,布鲁克总裁Frank Laukien表示,布鲁克致力于成为后基因组时代的领军企业,并已在蛋白质组学、多组学、空间和单细胞生物学领域树立了领导地位。Rohan表示,布鲁克是一家致力于自下而上蛋白质组学、单细胞蛋白质组学和空间蛋白质组学的公司,其构建的生态系统支持所有不同形式的蛋白质组学,并提供平台性的解决方案。比如有基于MALDI HiPLEX-IHC标签进行组织蛋白质组学研究方案,我们有血浆蛋白质组学方案,我们也提供基于细胞培养的蛋白质组学方案,我们还提供各种样品处理设备、消耗品和软件。
“大多数实验室都有来自多家供应商的质谱仪,客户还可以从布鲁克购买除质谱仪之外的产品,他们可以使用我们PreOmics的蛋白质组学样本处理方案, Biognosys的数据处理方案,客户可以处理包括布鲁克在内的任何质谱仪的蛋白质组学数据。布鲁克的质谱可以区分不同CCS值,对低水平信号的分析有更高的置信度,相较其它产品,我们在谱图分析方面更加可靠。”谈到和基因组学的不同Rohan表示:“显而易见的是,2万个基因并不会带来2万个蛋白质,实际情况是你会得到10万个不同的蛋白质亚型,以及大量的蛋白质翻译后修饰,因此2万个基因可能产生约100万种蛋白质。你将如何处理这些蛋白质亚型?一个很好的例子是,同一个基因在大脑、心脏、肝脏和其它组织中会产生不同的蛋白质亚型。因此,当你开始观察所有这些蛋白质时,你必须确保在肽水平上能够识别这些蛋白质亚型。布鲁克构建更灵敏、更稳健、更高通量的系统,并通过软件支持来定性定量更多的蛋白质,让科学家们更深刻地洞悉生命本质,从而在后基因组时代保持我们的领导地位。”
Rohan在谈到对人工智能的看法时表示:“布鲁克一直在开发 GPU 处理技术。我们更多地强调使用深度机器学习,而不是使用人工智能。目前人工智能只是学习公众领域的所有内容,只是收集信息就像一个巨大的图书馆,然后将其应用看看带来的变化。但人工智能的问题在于它不知道输出结论的正确与否,因此在科学仪器领域,我们认为目前人工智能并不那么适用,我们更倾向于使用已确认可以进行机器学习的训练模型,而不是完全依赖人工智能。深度机器学习是以非常受限的方式来学习具有边界条件的训练集。对于仪器你可以只给它噪音,也可以训练它使用噪音,但我们是在实际数据集上训练它。为机器学习设置的训练数据的边界条件至关重要;我们精心策划了这些训练数据,以便机器学习后输出得更好、更准确。“
Rohan谈及中国市场时表示:中国是布鲁克最重要的市场之一,中国科学家在使用这些先进工具方面表现出色,甚至在某些领域超过了欧美的同行。布鲁克致力于为中国客户提供最先进的技术和最优质的服务,帮助他们在科研领域取得更大的成就。对于中国的第三次大规模设备更新计划,Rohan赞道:“这是一个很棒的计划,表明中国正在投资于它的科学家和科学。从这个角度来说,我绝对祝贺中国,因为中国正在对未来进行投资。包括这次ASMS发布的新品在内,布鲁克有很多前沿的产品会帮助中国的科学家更好地开展科研探索。”
Rohan谈到布鲁克的未来战略时说:“我们的战略非常简单,那就是:让客户成功。同时,我们也投资于布鲁克的团队,培养和发展我们的员工和科技人员,让他们助力科学家们成功。如果客户成功,公司也就会成功。这是布鲁克持久的战略。”新品讲座信息: