“网络药理学”是中医药研究非常重要的工具。光宝也分享了很多类似思路。
有小伙伴反馈说，现在不少的网药文章包含有动物模型/多组学测序等实验内容，而自己现阶段缺乏实验条件和足够经费，还能怎么优化思路了？
看来大家真是“苦干湿结合的网药久矣”，那光宝今天就推荐一个可以上车的纯生信新赛道，虽然有点“换汤不换药”，但是创新性又提高的思路---“网络毒理学”。
其实，“网络毒理学”作为一门新兴的学科，是网络药理学的一个分支，主要应用于预测和评估药物的毒性成分，在中药领域中，尤其是在中药毒性成分预测（包括但不限于肝毒性、肾毒性、心脏毒性和急性毒性）发挥着重要作用。
基于此，光宝今天给大家分下的文章是发表在《Chemosphere》，论述农药噻菌灵毒性机理的一篇8分+纯数据分析文章，其优势如下：
1，“网络毒理学”方向选题新：如前文所述，除了中医药各种毒性成分研究之外，对于各类天然化学产物/人工合成物质的毒性机理进行分析，创新性高，竞争压力小，特别是现在大健康领域的关注度提高，可以多选择角度来尝试；
2，纯生信且分析难度低：“网络毒理学”作为“网络药理学”的分支，其分析思路、分析方法、分析工具/网站均有较大的重叠，可以丝滑过渡，不用再新学习太多内容，非常方便。
综上，“网络毒理学”创新性高于“网络药理学”，分析方法却可以参考网药，同样的配方，不同的思路，就能大大降低发表难度。2个月0实验就拿下1区8分文，不再是幻想。赶紧复现吧！PS：想复现这个思路但不知道如何入手？想个性化设计生信创新思路？快来扫码联系光宝吧！光宝这里有无数高分文章套路可复现！
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题目：农药噻菌灵毒性机理的网络毒理和分子对接研究
杂志：Chemosphere
影响因子：IF=8.1
发表时间：2024年7月
研究背景
噻菌灵（噻苯咪唑）作为一种广泛使用的农产品杀真菌剂和除臭剂，其疾病诱发因素和毒性成分间的关系仍需进一步澄清。本研究通过网络毒理学和分子对接技术，旨在深入探究噻苯咪唑的毒性特性及其作用机制，以期为食品安全和人类健康提供科学依据。
研究思路
首先，作者首先利用ADMETlab2.0和ADMETsar数据库，预测了噻苯咪唑可能诱发对肝损伤。进一步利用GeneCards和TCMIP数据库，构建肝损伤和肝癌的靶标文库；同时利用wiss Target Prediction和TCMIP数据库，获取了噻苯达唑可能的靶向调节基因集；将上述两个基因集取交集，最终初步获取噻苯咪唑诱发肝损伤的可能基因途径；对上述基因进行PPI构建、GO和KEGG等分析，构建药物-靶标-通路网络；最后对药物和靶点基因之间，进行了分子对接分析。
研究结果
1.噻苯咪唑的毒性分析
作者预测噻苯咪唑可能的生物学毒性，发现该药物主要与肝损伤有关（表1）。
表1：噻苯咪唑的毒性预测
2.噻苯咪唑诱导癌症和肝损伤的潜在靶点鉴定
在 GeneCards 和 TCMIP 数据库中分别获取了5000个肝癌和肝损伤的基因靶点。然后，同时利用wiss Target Prediction和TCMIP数据库，获取了噻苯达唑可能的靶向调节基因集。将2个基因集取交集后，共获得了噻苯达唑的29 个靶向调节肝癌和30个靶向调节肝损伤的靶点基因（图1）。
图1：噻苯咪唑诱导癌症和肝损伤的潜在靶点鉴定
3.PPI网络构建和核心靶点的GO/KEGG分析
通过PPI网络分析，作者成功识别了噻苯咪唑诱导癌症和肝损伤的关键靶点，其中CCNB1、CDK1、CDK2、CHEK1和EGFR与癌症相关，而CCNB1、EGFR、CHEK1和CDK2与肝损伤相关（图2）
图2：PPI网络构建和核心靶点的鉴定
GO和KEGG分析揭示，噻苯达唑影响与细胞周期G2/M转换、DNA复制及染色质重塑相关的靶点，这些通路在癌症和肝损伤中起关键作用（图3）。
图3：GO分析
4.药物-靶标-通路网络的构建和分子对接
作者通过Cytoscape软件构建了网络图，并揭示了噻苯咪唑影响癌症和肝损伤的分子机制。分子对接技术如G16W、Pymol、Autodock和AGFR进一步展示了噻苯咪唑与CDK1、CDK2、CHEK1、EGFR等关键蛋白的结合模式，为理解其毒性提供了分子层面的见解（表2）。
表2：分子对接结果
文章小结
怎么样，是不是看着很眼熟？用的还是“网络药理学”的工具和方法，但是却又走的“网药毒理学”路子，成功实现0实验2个月发8分的壮举。换个赛道，一下子轻松了。不是每个创新都要开天辟地，丝滑的转个身，也能达到预期。不想做实验的小伙伴，看好了，赶快下手哦。如果你想复现这个思路，但不知道怎么选研究目标，就快来联系光宝呦！晚了可能就被别人捷足先登了！
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