27天搞定1区TOP顶刊!还是纯生信??福建医科大团队,搭配多组学和细胞焦亡,一个月就从投稿到见刊!

文摘   2024-11-03 19:00   陕西  

看到题目,感觉有点夸张吧?光宝也这么觉得,但却是真的。

防止大家不信,来,先上图!

怎么样?4号投稿,31号接收,又过了10天就见刊,这速度,堪称坐火箭!

要知道,一个来月,甚至有的期刊还在找专家,还没送审了!

这边已经中科院1区12分文章拿到手了!!

如果告诉你这篇还是数据挖掘为主的,那有人就更坐不住了。    

虽然大家说Theranostics一本“水”里“水”气的Top期刊双一区,12.4分,国人十分友好,国人发文量第一,约63.307%),被国内某几个机构预警,不过毕竟也是1区TOP。

回到本篇文章,作者紧随“细胞焦亡”研究热潮,利用公共数据集构建并验证了多基因风险评分模型(PRS)模型,结合单细胞测序和多重免疫荧光技术,深入分析PRS在免疫治疗中的作用。

(ps:细胞焦亡是生信领域的研究热点,多组学分析+免疫治疗又给细胞焦亡提供了大大的助力,可以让生信小白瞬间起飞!对细胞焦亡感兴趣的小伙伴可以来找光宝哦!)

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题目:胃癌患者焦亡的综合多组学分析优化新辅助免疫治疗

发表时间:2024年5月

公众号回复“999”领取原文PDF,文献编号:241103

研究背景    

焦亡在免疫应答中起重要作用。然而,在胃癌(GC)中,焦亡对肿瘤微环境重塑和免疫治疗的影响尚不清楚。

数据来源

研究思路

作者利用GEO数据库(GSE15459、GSE54129、GSE62254)分析了细胞焦亡对免疫反应的影响,并利用TCGA数据集深入探讨了细胞焦亡与免疫调节及分子变化的关系,开发了细胞焦亡风险评分(PRS)。通过内部转录组和全外显子组数据确认了细胞焦亡与免疫调节的联系,并在三个公共数据库(925例)及四个中国医学队列(978例)的胃癌术后样本中验证了PRS的预后能力。研究还结合单细胞测序和免疫荧光技术,揭示了PRS与免疫细胞浸润的关系,并评估了PRS在新辅助免疫治疗(48例)及化疗(49例)中的预测效能。

研究结果

1. 细胞焦亡在胃癌微环境中起免疫调节作用

研究比较了细胞焦亡程度与免疫细胞浸润的关系。高焦亡组表现为免疫活跃肿瘤,与多种免疫细胞浸润相关。低焦亡组则显示免疫抑制特征。TIP算法揭示高焦亡组具有更强的抗肿瘤免疫反应。

图1 细胞焦亡在胃癌微环境中起免疫调节作用

2.焦亡风险评分的构建

研究识别了影响胃癌预后的细胞焦亡关键基因,并基于这些基因开发了胃癌诊断和治疗评估模型。通过比较高、低细胞焦亡组的差异表达基因,并运用LASSO-Cox回归分析,筛选出四个与预后密切相关的基因(PTPRJ、BATF2、RGS1、VCAN),构建了预后风险评分(PRS)模型

2焦亡风险评分构建

3. PRS的预后疗效及临床特征的验证

研究在多个数据库和中国医学队列中验证了PRS对胃癌预后的重要性。ROC曲线和生存分析表明,PRS在预测预后方面优于传统因素,且低风险组患者生存期更长,Cox回归分析进一步确认了PRS的预后意义。

3 PRS的预后疗效及临床特征的验证

文章小结

本研究揭示细胞焦亡促进肿瘤免疫反应,低PRS关联免疫细胞浸润增强、焦亡活性提升及患者预后改善。构建的PRS为GC患者免疫治疗提供定量分析工具。文章聚焦“细胞焦亡”,结合单细胞数据和免疫荧光技术,更是把文章提升了一个台阶,12分+轻松到手!。想在细胞焦亡方向做点新东西的小伙伴,不要错过这个好思路,可以换个疾病复现,还可以拓展做国自然课题,一举两得,有需要的小伙伴可以来找光宝做设计哟~

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