孟德尔随机化(MR)已经盛行一段时间了,第一波人都吃到红利了!当然,现在入场也并不晚,只是我们需要用到新思路和新方法了。毕竟,数据不会说谎,让我们用事实说话。人类对孟德尔随机化的开发不足1%(笑:-D)。MR本是确认“暴露”与“结果”之间因果关系的工具,那么,当我们把“暴露”与“结果”替换为两种疾病,也就是论述“疾病X”与“疾病Y”之间是否存在因果关系,这就是经典的“双疾病分析”了。将MR与双疾病分析进行串联,则是目前创新性非常高的思路。当然,“双疾病分析”虽然香,也是很讲技巧的。比如,两种疾病该如何选择了?有什么原则了?是不是所有的两种疾病都能作分析了?所以光宝今天给大家推荐的文献,就能很好的解答这个问题。按照这个思路来选择,既无违和感,又创新性强!好的,光宝不卖关子了,今天这篇文献利用MR分析慢性阻塞性肺病 (COPD) 与抑郁症的因果关系。那既然精神类疾病可以研究COPD,那是否能研究其他疾病了?这样一发散,新思路不就都来了。将MR与双疾病串联,是当前非常好的研究思路。除了本文提到的精神系统疾病,其实免疫性疾病、代谢性疾病、循环系统疾病、肿瘤等也都非常适用。小伙伴如果感兴趣,就多多点赞或者留言反馈,光宝会给大家推荐其它相关思路。(ps:光宝这里现在就有几个自我感觉很精彩的双疾病+MR的创新点子,被抢发了也确实可惜,如果对这个思路感兴趣,但暂时没想到好的研究角度,或者数据获取、分析等存在技术限制,欢迎找光宝来拿吧)。定制生信分析
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题目:评估慢性阻塞性肺疾病与抑郁症之间的因果关系:一项双向孟德尔随机化研究
杂志:Journal of Affective Disorders
影响因子:IF=4.9
发表时间:2024年2月
公众号回复【999】领取原文PDF文献,文献编号:241021
研究背景
慢性阻塞性肺病(COPD)表现为持续的呼吸道问题,常与抑郁共存。研究显示,COPD患者中抑郁比例为10%-57%,但两者的因果联系直接证据很少。数据来源
研究思路
本研究采用双样本孟德尔随机化法,遵循三个原则:遗传工具变量(IV)与暴露高度相关(P < 5×10-8,F统计量>10),无暴露与结果间的混杂因素,IV仅通过暴露影响结果。通过MR-Egger回归等五种方法探讨COPD与抑郁的遗传联系。分析运用R软件和TwoSampleMR包,显著性水平P < 0.05。
主要结果
1.工具变量选择
筛选与疾病关联紧密的SNP(P<5×10^-8,F>10)。从FinnGen、PGC和UKB等数据库中选出74个SNP作为初步工具变量,进一步协调数据后,选定的SNP将用于后续的孟德尔随机化分析。IVW分析显示,COPD遗传倾向与抑郁无显著关联。Cochrane Q检验揭示数据异质性显著(P=0.000286),MR-Egger截距未发现COPD定向多效性证据(P=0.226)。(表1)(图1)。表1 慢性阻塞性肺病与抑郁症之间关系的MR结果
图1 慢性阻塞性肺病对抑郁症的因果效应
3. 抑郁症与慢性阻塞性肺病的因果关系
反向孟德尔随机化分析显示,高遗传性抑郁倾向可能促进COPD发展。Cochrane Q检验揭示数据异质性(P=0.003),MR-Egger截距未发现显著的定向多效性(P=0.186)(表2)(图2)。表2 抑郁症与慢性阻塞性肺病之间关系的MR结果
图2 抑郁症对慢性阻塞性肺病的因果影响
4. 补充分析检查抑郁症与慢性阻塞性肺病之间的因果关系
在补充孟德尔随机化分析中,发现了进一步的证据支持这样一种观点,即较高的抑郁症遗传易感性可能是导致COPD发病的一个因素。值得注意的是,Cochrane的Q检验显示这些结果中没有显著的异质性(0.720)。此外,MR-Egger截距表明在凹陷中不存在定向多效性(P = 0.629)(表3)(图3)。表3 抑郁症与慢性阻塞性肺病之间关系的MR结果
图3 抑郁症对慢性阻塞性肺病的因果效应-补充分析
文章小结
综上,本文利用MR分析,确定COPD不会增加抑郁症的风险,也就是说,本文是一个阴性结果。当然,相比一般的分子机制实验,阴性结果在MR分析中相对常见,也是能被期刊接受的。总之,MR+双疾病,既是兼顾临床和基础的理想思路,同时也是当前MR内卷中的一条极有价值的出路,各位医生朋友不要错过这个点哦。光宝从文献阅读中,想到几个创新性非常高的思路,快来拿吧!需要各种文章思路复现,记得来找我吧!
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