文献阅读|高富集悬浮态厌氧氨氧化细菌的氧耐受性和解毒机制

文摘   2024-06-21 09:02   浙江  


文章标题Oxygen tolerance and detoxification mechanisms of highly enriched planktonic anaerobic ammonium-oxidizing(anammox) bacteria

通讯作者:Satoshi Okabe

第一单位Hokkaido University

期刊:ISME Communications

时间:2023

论文链接:https://doi.org/10.1038/s43705-023-00251-7

文章摘要
氧是厌氧氨氧化(anammox)的关键调控因子,测定厌氧氨氧化菌1个海洋种(Ca.Scalindua sp.)和4个淡水厌氧种(Ca. Brocadia sinica、Ca. Brocadia sapporoensis、Ca. Jettenia caeni和Ca. Kuenenia stuttgartiensis)的抗氧化酶活性,研究其氧耐受性和解毒机制。结果发现海洋厌氧氨氧化物种Ca. Scalindua sp.的耐氧能力(IC50 = 18.0µM, DOmax = 51.6µM)明显高于淡水物种(IC50 = 2.7 ~ 4.2µM, DOmax = 10.9 ~ 26.6µM)。进一步采用比较基因组分析,证实只有Scalindua表现出较高的超氧化物歧化酶(Sod)活性(22.6±1.9 U/mg-protein)和中等的过氧化氢酶(Cat)活性(1.6±0.7 U/mg-protein)。这种依赖Sod-Cat的解毒系统可能是Scalindua比其他缺乏Sod活性的淡水厌氧氨氧化物种具有更高的氧耐受性的原因。


主要内容

1、生物质制备

      从各个MBR反应器中收集浮游态厌氧氨氧化菌,在缺氧条件下离心,并在厌氧室中用不含铵和亚硝酸盐的缺氧无机培养基洗涤三次(用N2净化1h)。为了进一步净化MBR厌氧氨氧化培养物,采用Percoll法进行密度梯度分离。经过Percoll净化后的生物质在厌氧室中无NH4+和NO2,Percoll净化已被证实对厌氧氨氧化活性没有影响。通过FISH分析证实厌氧氨氧化菌占总生物量的98%以上。

图1 Percoll纯化的浮游厌氧氨氧化细菌细胞的FISH图像

2、氧气浓度对厌氧氨氧化活性(SAA)的影响

      Scalindua属的DO浓度基本保持不变,可以稳定产生29N2,无滞后时间。其余四种淡水厌氧氨氧化菌的29N2产气开始逐渐延迟(滞后时间),29N2产气速率随着O2浓度的增加而下降。

图2 厌氧氨氧化颗粒在门水平上的分类及其基于MAGs的系统发育分析

    通过相对MSAA(%)对O2浓度对MSAA的影响进行了评估(图3)。淡水厌氧氨氧化菌的相对MSAA随着O2浓度的增加而急剧下降,渐近为零。在>1.0% O2条件下(对应于25°C和37°C下的15.2µM和18µM DO),几乎没有检测到显著的厌氧氨氧化活性。相比之下,“Ca. Scalindua sp.”的MSAA在2.0%的O2(36µM DO)依然可以检测到相应的活性,从而揭示了其在厌氧氨氧化菌中表现出最低的O2敏感性。


图3 O2浓度对五种不同厌氧氨氧化菌相对最大比活性(MSAA)的影响


3氧降解速率

Ca. B. sinica”, “Ca. K. stuttgartiensis”, and “Ca. Scalindua sp.”在氧气(约0.18-0.20%顶空气氧)存在下培养。对于这三种厌氧氨氧化菌,在分批培养中产生29N2时,O2随着培养时间的推移逐渐减少。Ca. B. sinica、Ca. Scalindua sp.的氧降解速率相似(0.26 nmol O2/g-蛋白/h),Ca. K. stuttgartiensis的氧降解速率更高(0.53nmol O2/g-蛋白/h)。Ca. B. sinica、Ca. K. stuttgartiensis和Ca. Scalindua sp.的29N2产生速率分别为3.31 µmol、3.91 µmol 和3.44 µmol N2/g-蛋白/h。实验结果为O2的降解速率比29N2产生速率低了4个数量级,表明氧气被还原更可能为解毒作用而非呼吸作用。


图4 氧还原速率的测定


4、不同厌氧氨氧化菌中抗氧化酶的活性

     通过四种厌氧氨氧化菌的主要抗氧化酶(Sod、Cat、Ccp和Gpx)的活性解释物种间O2耐受的差异性。与此同时,氧耐受性直接关系到细菌消耗O2和解毒O2•-的能力(即Sod活性)。主要是由于O2•-比H2O2毒性更大,而过氧化氢酶活性与氧耐受性没有明确的相关性,所以Cat是较为次要的决定因素。与其他淡水物种相比,Scalindua sp.具有更高的Sod活性,表现出更高的氧耐受性。Scalindua sp.可能主要通过Sod来解毒O2•-,而其他4种淡水物种由于缺乏Sod活性而不能有效解毒O2•-。在氧气存在的情况下,厌氧氨氧化菌可以将氧气还原为有毒的活性氧(ROS),或通过过氧化物还原酶(Sor)将其还原为水。


图5 抗氧化酶的活性

总结

综上所述海洋物种“Ca. Scalindua sp.”表现出比其他淡水厌氧氨氧化菌更高的氧气耐受性和可逆性,主要是由于其含有Sod-Cat的ROS解毒系统。此外,Ca. Scalindua sp.的DO上限(~51.6µM)远高于迄今为止报道的值(~20µM),这也说明了厌氧氨氧化对海洋氮损失的贡献率可能比之前所预估的要更高。


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来源|浙江大学环境微生物课题组

推文作者|季文杰

责任编辑|朱林



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