文献阅读|硫化铜矿物通过联氨中间体进行非酶厌氧氨氧化

文摘   2024-06-14 12:11   浙江  

原题

Copper sulfide mineral performs non-enzymatic anaerobic ammonium oxidation through a hydrazine intermediate

第一作者何道平

通讯作者:何道平,Ryuhei Nakamura 

第一单位:Earth-Life Science Institute, Tokyo Institute of Technology

期刊:Nature Chemistry

时间:2024

论文链接:https://doi.org/10.1038/s41557-024-01537-6


文章背景

厌氧氨氧化(Anammox)是用亚硝酸盐活化铵的生物过程,也是海洋环境中N2产生的重要原因。然而,尽管进行了几十年的生化研究,还没有发现厌氧氨氧化的合成模型。文章报道了硫化铜矿物重构的由三种金属酶催化的厌氧氨氧化过程。由亚硝酸盐还原形成的铜-亚硝基{CuNO}10配合物,作为氨氧化的氧化剂,导致亚硝酸盐和氨形成异裂N-N键;N-N键异偶联途径形成了N2O。该研究将非生物氮循环中的六种氧化还原状态相互联系起来,同时也将促进与N-N和N-杂原子键形成相关的氨基化学的基础研究

图1 提出的非酶介导的厌氧氨氧化的反应机理

主要内容

1、厌氧氨氧化催化剂筛选

考察几种天然金属、金属硫化物、金属氧化物以及金属氢氧化物的催化活性。以14NO2−和15NH4+为底物,在pH为7的氦净化磷酸盐缓冲液中进行催化剂筛选,并通过气相色谱-质谱(GC-MS)分析异偶联氮化合物。在测试的37种材料中,只有CuS具有生成29N2 (14N15N)的活性。X射线衍射和拉曼图谱分析显示,合成的CuS具有典型的天然铜蓝矿物的结构。



图2 非酶促厌氧氨氧化的矿物筛选

2、NO介导的厌氧氨氧化

细菌厌氧氨氧化中异裂N-N键形成是由NO2−生成NO引发的。与生物过程类似,CuS也催化了NO的形成以及后续涉及NH4+的N-N耦合。

以漫射紫外-可见(DT UV-vis)光谱,并监测了NO-Cu配位中间体的形成。发现在508nm处出现了新的吸收带。该波段是铜-亚硝基络合物d-π*电荷转移(CT)跃迁的特征,该络合物存在于反硝化细菌的亚硝基铜还原酶(CuNIR)中。Cu(II)的d-d跃迁伴随的损耗表明,铜-亚硝基铵配合物具有d10电子构型,与Enemark-Feltham注释中{CuNO}10的描述一致,这是由NO到Cu(II)中心的CT产生的。


图3 无酶厌氧氨氧化反应中NO的测定

图4 CuS中NO介导的厌氧氨氧化反应机理

3、联氨的产生与氧化

基于对铜-亚硝基铵作为该反应中间体的光谱检测,利用四极杆飞行时间质谱(QTOF-MS)研究了Cu催化厌氧氨氧化反应中N2H4的生成情况。在联氨与对二甲氨基苯甲醛的衍生化反应中,QTOF-MS检测到一种高活性、短寿命的联氨中间体。

联氨的N-H键裂解生成N2需要CuS,而联氨与亚硝酸盐直接反应生成杂化物29N2O无需CuS。这两种途径都提供4个电子来完成从-3到+3氧化还原态的非酶促厌氧氨氧化循环。此外,两种平行途径的存在解释了为什么CuS催化厌氧氨氧化产生具有不同寻常同位素组成的杂化N2O以及异偶联29N2

图5 联氨的生成与氧化

总结与展望

本研究阐明了通过联氨中间体进行的非酶促厌氧氨氧化反应,并鉴定了产物。硫化铜矿物在模拟生物合成过程中表现出独特的催化活性,为非生物氮循环提供了重要的合成模型,并有潜力应用于需要氨激活的领域,如氨基燃料电池、工业火箭燃料合成和氮污染的环境修复。未来研究将探索使用原位生成的联氨作为合成氨基酸和核碱基的试剂,以扩展非酶促Anammox在前生物化学中的应用,并促进与形成N-N和N-杂原子键相关的氨基化学的基础研究。

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来源|浙江大学环境微生物课题组

本文编辑|王佳惠

责任编辑|朱林


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